代谢组学通路图

  • 西湖大学发现新冠重症患者重要生物标志物
    答:COVID-19感染后根据组学数据推测的重症患者体内的巨噬细胞、血小板、补体系统的作用通路图。这些蛋白质和代谢物有望成为提前诊断重症患者的生物标记物和治疗的靶点。此外,郭天南团队在质谱分析数据的基础上,使用机器学习方法进一步“沙里淘金”,筛选出重症患者特征性的22个蛋白质和7个代谢物。血清样本成分...
  • ...丨脓毒症相关肝功能障碍的新型时间依赖性多组学整合
    答:在蛋白质组学层面,SerpinA3N的表达在SALD中显著增加,显示出与炎症的紧密联系。DEP分析显示SerpinA3N上调的同时,Mup1家族成员减少,这些变化可能影响SALD的发展进程。代谢组学研究则发现,CLP后血液中的代谢途径发生显著变化,其中22个代谢物显示出高度的差异性。多维度解码:SerpinA3N与炎症的纽带</,...
  • 紧急求助,代谢组学的代谢通路富集分析和MYROLE该怎么用
    答:代谢组学是对一系列相似的生物样本中的代谢物进行比较分析的学科。代谢物在生物系统中起着至关重要的作用,因此代谢组学可用于发现和鉴定生物标志物,或更好地了解药物或疾病对已知和未知生物通路的影响。成功的代谢物组学研究依赖于有效的代谢物提取。对于非靶向代谢组学研究,需要提取细胞和体液中的多种...
  • 生物信息学的实际应用有什么?
    答:四、代谢组学 代谢组学是研究生物体内代谢产物的种类、分布和变化规律的学科。生物信息学在代谢组学中的应用主要包括代谢物鉴定、通路分析和代谢物组学等方面。代谢物鉴定和定量代谢物鉴定和定量是指对生物样品中的代谢产物进行检测和鉴定,并确定其化学结构和含量的过程。生物信息学方法可以通过质谱数据处理...
  • 如何找到新的细胞通路
    答:1.基因组学和转录组学:利用全基因组测序和转录组测序(RNA-seq)来识别未知基因和潜在的调控元件。对比不同条件(如应激、药物处理、疾病状态等)下的表达数据,以找出可能涉及新通路的基因 2.蛋白质组学:通过研究蛋白质的表达、相互作用和修饰,可以识别出新的蛋白质通路和信号转导过程。3.代谢组...
  • 康比特mass和sfmass有啥区别
    答:1、应用场景不同:康比特mass适用于各种质谱数据的分析和解释,包括代谢组学、蛋白质组学、化学组合物等领域,而sfmass主要用于小分子有机化合物的结构解析,特别是在合成有机化学中,能够辅助合成路线的设计和优化。2、功能特点不同:康比特mass具备基于质谱数据的统计分析、全息图、代谢通路分析、定量分析...
  • 高通量测序高分文章分析,测序技术怎么选,看这篇就够了!
    答:4. 表观组学的精细调控表观基因组学研究DNA和组蛋白修饰,对于理解疾病机制具有深远意义,如《人和小鼠三叉神经节细胞图谱》展示了代谢组学和微生物组学在偏头痛研究中的关键作用。5. 微塑料与健康的影响高分论文《聚苯乙烯微塑料与胰岛素抵抗》(Environ Int, IF 13.352)揭示了微塑料可能通过影响肠道-肝...
  • 人工智能在药物研发中的应用(上):AI与制药场景如何相互“适配”?_百 ...
    答:从患者的样本中、海量的生物医学资料中提取基因组学、蛋白质组学、代谢组学等多组学数据,借助深度学习来分析非疾病和疾病状态之间的差异,也可用来发现对疾病有影响的蛋白质。 / / 基于表型的药物发现 在过去的三十多年里,基于靶点的药物发现都是药物发现的主要方法。近年来,基于表型的药物发现(直接使用生物系统...
  • 泛癌分析,泛癌是什么?
    答:"泛癌"(pan-cancer)是一个相对较新的术语,通常在癌症基因组学和转录组学的研究中使用。它指的是跨多种癌症类型或亚型进行的整合分析,而不是专注于单一癌症类型。泛癌分析旨在识别在多种癌症类型中共有的基因、通路、生物标志物或其他特征,这些可能是由共同的分子机制或生物过程驱动的。进行泛癌...
  • 单变量统计分析包括:___。
    答:2、并为编制分布数列提供基础;在统计分析阶段则可以通过统计分组法来划分现象类型、研究总体内在结构、比较不同类或组之间的差异(显著性检验)和分析不同变量之间的相关关系。3、回归分析:确定两种或两种以上变数间相互依赖的定量关系的一种统计分析方法方差分析:用于两个及两个以上样本均数差别的显著性...

  • 网友评论:

    夏项13827211734: 代谢组学分析流程是怎样的?
    11169吕希 : 代谢组学分析流程包含按照SOP进行样本收集、样本前处理、选择代谢组学平台进行分析(NMR、LC-MS、GC-MS)、下机数据前处理、统计学分析、代谢通路分析、多组学关联分析,最终形成完整的分析报告.

    夏项13827211734: 差异代谢物分析的KEGG通路展示是什么?
    11169吕希 : 代谢组分析的主要目的是寻找不同组间具有重要生物学意义的差异代谢物,以阐明生物体的代谢过程和生理变化机制.而差异代谢物的筛选是代谢组分析中最重要的一环,后续的代谢通路分析、代谢网络分析、多组学分析等都是基于差异代谢物进行的.

    夏项13827211734: 紧急求助,代谢组学的代谢通路富集分析和MYROLE该怎么用 -
    11169吕希 : 代谢组学的代谢通路富集分析和MYROLE该怎么用 代谢组学是对一系列相似的生物样本中的代谢物进行比较分析的学科.代谢物在生物系统中起着至关重要的作用,因此代谢组学可用于发现和鉴定生物标志物,或更好地了解药物或疾病对已知...

    夏项13827211734: 代谢组学的研究范围 -
    11169吕希 : 代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物(MW<1000). 在食品安全领域,利用代谢组学工具发现农兽药等在动植物体内的相关生物标志物也是一个热点领域.其样品主要是动植物的细胞和组织的提取液.主要技术手段是核磁共振(NMR),质谱(MS),色谱(HPLC,GC)及色谱质谱联用技术.通过检测一系列样品的NMR 谱图,再结合模式识别方法,可以判断出生物体的病理生理状态,并有可能找出与之相关的生物标志物(biomarker).为相关预警信号提供一个预知平台.

    夏项13827211734: 初生代谢物分子量大还是次生代谢物分子量大? -
    11169吕希 : 初生代谢物产物,如糖类,脂类这些物质的分子量很大,又称大分子化合物. 次生代谢物,如生物碱,糖苷,由于这些化合物分子量较小,又被称为,小分子化合物

    夏项13827211734: 代谢组学的发展前景 -
    11169吕希 : 更好的“组学”? 代谢组学是继基因组学、蛋白质组学、转录组学后出现的新兴“组学”,自1999年以来,每年发表的代谢组学研究的文章数量都在不断增加.从表面上看,代谢组学的发展很迅速,但是仍然远远落后于基因组学和蛋白质组学...

    夏项13827211734: 非靶向代谢组学 靶向代谢组学 怎么选择 -
    11169吕希 : 靶向代谢组学新技术,区别于传统的非定向代谢组学,具有如下优势: 1.样品种类多:生物流体(血液、尿、唾液、肠道微生物)、环境样品、细胞、动植物组织、污水、药品、食品. 2.化合物涵盖广:包括脂类、维生素、核苷酸、神经递质等700种代谢产物,涵盖所有主要代谢途径. 3.分析时间短:我们的方法能在30min同时测定并准确鉴定出700种化合物. 4.复杂的数据处理:专业的数据处理方法和软件,能对所得数据进行PLS-DA,PCA,ANOVA,VIP,Biomarker等分析.

    夏项13827211734: metabonomics 和 metabolomics 有何区别 -
    11169吕希 : 代谢组学(metabonomics/metabolomics)是对一个生物系统的细胞在给定时间和条件下所有小分子代谢物质的定量分析[1],从而定量描述生物内源性代谢物质的整体及其对内因和外因变化应答规律的科学.metabonomics和metabolomics均可以译为代谢组学,但是两者既有区别又相互联系.metabonomic直译为“代谢组学”,是对生物系统进行整体及其动态变化规律的研究;metabolomic则主要强调代谢物的分析,又可以译为“代谢物组学”,是一个静态的概念.

    夏项13827211734: UPLC含义 -
    11169吕希 : 超高效液相色谱(UPLC)的应用本文为药物分析网所有,转载请注明超高效液相色谱是分离科学中的一个全新类别, UPLC借助于HPLC的理论及原理,涵盖了小颗粒填料、非常低系统体积及快速检测手段等全新技术,增加了分析的通量、...

    夏项13827211734: 与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有何优点? -
    11169吕希 :[答案] 那年夏天Forever与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有以下优点:①代谢组学放大了基因和蛋白表达的微小变化,从而使检测更容易;②代谢组学的研究不需建立全基因组测序及大量表达序列 标签(EST)的数据库,且代谢产物的种类要远小于...

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