atac-seq原理
答:ChIP-Seq原理是:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP) 特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段 ,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。ATAC-seq是 全基因组范围 内,找出所有的OCR。
答:ATAC-seq,全称"Assay for Targeting Accessible Chromatin with high-throughput sequencing",是一种高通量测序技术,用于揭示染色质区域的调控因子结合位点,以及转录因子对核小体位置的影响。其核心原理是利用活性的Tn5转座酶在开放染色质区域(OCR)插入测序接头,然后进行测序,从而推断可接近性区域的特征。
答:2. ATAC-seqATAC-seq用于评估全基因组染色质可及性,通过Tn5转座酶识别开放染色质区域,反映基因活动状态。2.1 定义:通过转座酶探查可访问的DNA区域,检测染色质的活跃程度。2.2 意义:染色质可及性与基因转录密切相关,ATAC-seq描绘了转录因子结合区域和核小体位置。2.3 流程:包括样品制备、转座、...
答:ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)是一种用于研究染色质开放区域(即易于转录因子和其他蛋白质结合的DNA区域)的技术。ATAC-seq利用一个被称为Tn5转座酶的蛋白质将测序接头插入到活跃的染色质区域,转座酶的作用导致DNA断裂,产生长度不等的DNA片段。这些片段反映了染色...
答:ATAC-seq技术的创新之处在于,它通过DNA转座酶对特定时空下开放的核染色质区域进行切割,以此获取基因组中在该特定时空下所有活跃转录的调控序列。这项技术提供了关于基因组活跃区域的详细信息,对于理解基因表达调控机制具有重要意义。细胞核内的DNA由DNA分子和蛋白质共同构成,每条染色单体为一个线性DNA分子...
答:ATAC-seq:(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing)是用于研究染色质可及性(通常也理解为染色质的开放性)的方法, 原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质的特性,然后对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序。染色体由核小体为单元组成,而蛋白质缠绕(我记得是1.75圈...
答:ATAC-seq全名Assay for Transposase Accessible Chromatin,其核心在于利用转座酶检测染色质的可进入性。染色质结构复杂,DNA与组蛋白紧密缠绕形成串珠状,折叠成微型染色体,便于存储于细胞核内。基因表达过程需要解开部分染色质结构,即开放染色质,这涉及组蛋白修饰,特别是乙酰化的作用。传统方法如MNase-seq...
答:ATAC-seq与ChIP-seq等其他测序方法有异同,例如ChIP-seq主要研究特定转录因子的结合位点,而ATAC-seq则能检测全基因组开放区域。它们在峰形和应用上有所不同:ChIP-seq的峰代表转录因子结合点,ATAC-seq的峰则代表开放区域两端。ATAC-seq适用于未知转录因子的筛选,而ChIP-seq则针对已知转录因子进行特异性...
答:[4]所以ATAC-seq利用这个特点,将测序所用adaptor加在Tn5转座酶上,这样Tn5转座酶就可以将adaptor添加到开放染色质区域的DNA两端,这样就可以对这部分序列进行测序了。(当然作者们对其可行性进行了一波三折的评估,包括将其与之前经典的染色质结构研究组学技术 DNase-Seq 和 FAIRE-Seq 结果的比较)还有其...
答:入门ATAC-seq分析,首先需要理解数据处理流程,如碱基质控、mapping、序列筛选、reads的移动、peak calling等环节。数据处理后,通过bed和bw文件进行可视化和分析,质量控制是关键,如确保足够的覆盖度和信噪比,以及重复性和重复peak的评估。常规下游分析包括绘制热图,进行功能注释,以及对特定区域的选取和操作...
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谯泰13273208783:
狄尔斯 - 阿尔德反应的机理 -
15055孟花
: 狄尔斯-阿尔德反应是共轭双烯体系与烯或炔键发生环加成反应而得环己烯或1,4-环己二烯环系的反应.1928年德国化学家O.P.H.狄尔斯和K.阿尔德在研究丁二烯与顺丁烯二酐作用时发现这类反应:在这类反应中,与共轭双烯作用的烯和炔称为亲...
谯泰13273208783:
高一生物:斐林试剂与班氏试剂检测原理 -
15055孟花
: 斐林试剂和班氏试剂 关于斐林试剂和班氏试剂,可用下面的例题引出其异同点:例:你可用什么方法,检验人的尿液中是否含有糖? 答案: 方法一:在试管中加入人的尿液0.1mL,加入班氏糖定性试剂1mL,混合均匀后,将试管放入盛有开...
谯泰13273208783:
社会总资本的基本原理 -
15055孟花
: ①社会总产品的实物形态是由生产资料和生活资料两大类构成的,与此相对应,社会生产便分为两大部类:一类是制造生产资料的部类,称作第一部类,用符号“Ⅰ”表示;一类是制造生活资料的部类,称作第二部类,用符号“Ⅱ”表示. ②...
谯泰13273208783:
求可溶性还原糖,蛋白质和脂肪的鉴定原理 -
15055孟花
: 1.可溶性还原糖鉴定原理生物组织中普遍存在的可溶性糖类较多,有葡萄糖、果糖、麦芽糖和蔗糖.前三种糖的分子内都含有游离的具还原性的半缩醛羟基,因此叫做还原糖;蔗糖分子内没有,为非还原糖.实验中所用的斐林试剂,只能鉴定...
谯泰13273208783:
过流检测电路原理分析 -
15055孟花
: 这是一个简单的电压比较器电路,用作过电流检测.核心器件是比较器LM2903M,正常运行时,比较器的1脚输出高电平.因为,同相输入端3脚电压约为15Vx2K/(22.1K+2K)=1.245V,而反相输入端2脚,基本为0V. 如果R41的右边与地相连的话,电路才完整.且当电阻R41两端电压升高到一定程度(因为检测到的电流很大时),三极管Q2导通,R41上的电压,经R37、R38、R39分压后,施加在比较器的2脚.当这个分压值,使得2脚电压高过上边的设定值1.245V时,比较器翻转,输出端1脚变成低电平,完成过电流检测功能.
谯泰13273208783:
误用检测和异常检测的基本原理 -
15055孟花
: 异常检测异常检测通常用于检测系统内容错误,当系统内容错误时将发出执行异常事件.具体使用方法时,在“检测执行内容”事件中,设置所要执行的命令.然后执行其方法'检测执行'.如果发现命令错误时,就发出执行异常事件. 注意:...
谯泰13273208783:
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15055孟花
: 在建筑工程中,对各种不同方式成桩且承载上部荷载的桩基础的桩所进行的质量检测方法;大应变检测(也叫高应变检测)的目的与作用是测出桩的桩身完整性和承载力. 大应变检测试桩的基本原理:用重锤冲击桩顶(见右图),使桩-土产生...
谯泰13273208783:
绩效考核的SMART原则? -
15055孟花
: 第一节 绩效考核基本分析 一、绩效考核范畴 绩效考核,是对员工在工作过程中表现出来的工作业绩、工作能力、工作态度以及个人品德等进行评价,并用之判断员工与岗位的要求是否相称. 绩效考核公式:P=f (s、m、o、e).各因素的含义. ...
谯泰13273208783:
简述PLC的扫描工作原理. -
15055孟花
: PLC的扫描基本工作原理: PLC采用“顺序扫描,不断循环”的工作方式. 1.每次扫描过程.集中对输入信号进行采样.集中对输出信号进行刷新. 2.输入刷新过程.当输入端口关闭时,程序在进行执行阶段时,输入端有新状态,新状态不能被读入.只有程序进行下一次扫描时,新状态才被读入. 3.一个扫描周期分为输入采样,程序执行,输出刷新. 4.元件映象寄存器的内容是随着程序的执行变化而变化的. 5.扫描周期的长短由三条决定.(1)CPU执行指令的速度(2)指令本身占有的时间(3)指令条数 6.由于采用集中采样.集中输出的方式.存在输入/输出滞后的现象,即输入/输出响应延迟.
谯泰13273208783:
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15055孟花
: 游标卡尺简介大商圈网www.bbspace.cn 2007-08-02 来源:中国数控机床网游标卡尺是一种比较精密的量具,在测量中用得最多.通常用来测量精度较高的工件,它可测量工件的外直线尺寸、宽度和高度,有的还可用来测量槽的深度.如果按...