merip-seq原理
答：专注于表观组学研究的深圳市易基因科技，作为多组学科研服务的领先者，提供甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)信息分析的详细流程。首先，原始的FASTQ格式下机数据需经过质控，使用Trimmomatic去除接头序列和低质量碱基，参数设置为特定值。然后，经过过滤的序列通过hisat2软件比对到参考基因组，形成m6A...
答：所以， RNA-蛋白质 、 蛋白-蛋白互作 ，也是MeRIP-seq后续实验验证关注点，那么让我们看看验证RNA与蛋白以及蛋白质之间相互作用的实验有哪些吧~主要是用来研究体内 RNA与蛋白结合 情况。比如，检测 reader蛋白与RNA 的具体结合情况。该方法具体是利用 针对目标蛋白的抗体 把相应的 RNA-蛋白复合物沉淀 下来...
答：7. 图注：A为MeRIP-Seq的数据分析中mRNA甲基化的信息，B为Ldlr mRNA的RNA-RNApull-down后进行m6A免疫检测验证Ldlr mRNA甲基化。8. MeRIP-Seq数据分析揭示了m6A集中在特定的motif上，如G[AG]ACU和其变体[AC]GAC[GU], GGAC, [AU][CG]G[AG]AC，而在富含尿嘧啶（U）的motif上几乎不含m6A。9. ...
答：易基因独家解析：深入剖析经典软件exomePeak在m6A peak鉴定中的核心原理 exomePeak作为MeRIP-seq数据分析的强大工具，由孟佳课题组开发，历经语言更新，如今以R语言版本简化操作。它的核心在于利用Poisson分布和C检验算法，通过IP样本和Input对照样本的reads数量比较，精确鉴定RNA甲基化位点peak，尤其适合m6A-seq...
答：MeRIP-Seq技术的出现，使得研究m6A甲基化修饰在全转录组层面成为可能。传统的数据分析方法难以应对MeRIP-Seq数据的特性，如重复样本少、空间相关性以及大量零数据。BaySeqPeak通过采用零膨胀负二项分布、隐马尔可夫模型和贝叶斯统计，有效解决了这些问题，提高了预测准确性。在模拟和真实数据测试中，BaySeqPeak...
答：MeRIP-seq建库步骤: 1. 提取total RNAs,并用Oligo-dT磁珠对total RNAs带有polyA的mRNA进行富集(通常要求Total RNA 300ug,人鼠可以做微量2ug 但结果可能会出现map率低dup率高 建库步骤与常量也有区别); 2. 用磁珠进行富集,得到带有polyA的mRNA。之后加入片段化试剂,将完整的mRNA进行片段化。或者使用超声波仪直接...
答：MeRIP-seq操作 第一步先对mRNA进行片段化,接下来使用带有m6A抗体的免疫磁珠对发生m6A甲基化的mRNA片段进行富集,然后将富集到的mRNA片段纯化后构建高通量测序文库进行上机测序。另外需要单独构建一个普通的转录组文库作为对照。最后将2个测序文库放在一起进行生物信息学分析,得到m6A甲基化程度较高的区域(m6A peak)。 这...
答：自己评估下结果差异，再做定夺。（研究本来就是充满了不确定性，一切都只能用“可能性”来定义，所以，采用同样参数仍然无法完全重复出文献中的结果也是常见。即使你心有芥蒂...）针对配合meRIP-seq的RNA-seq，因为朋友需要看了几篇文献，基本都是2 vs. 2的样本量，文献里的作法也有差异。
答：MeRIP-Seq之exomePeak2使用教程peak 差异分析：注意事项：比对时参考基因组一定为hg38.fa,不然会报错。
网友评论：
宫师15098631104：
麦克尔加成的反应机理? -
67685桂峰
： 最有价值的有机合成反应之一,是构筑碳-碳键的最常用方法之一.有时也称为1,4-加成、共轭加成.是亲核试剂对α,β-不饱和羰基化合物发生的β位碳原子发生的加成反应.在逆合成分析中属于亲核试剂对a3合成子发生的反应.
宫师15098631104：
有没有 RNA 甲基化测序的技术 -
67685桂峰
： 4%以上;测序覆盖度是反映测序随机性的指标之一,则可覆盖基因组的约99测序覆盖度.当深度达到5X时:基因组被测序得到的碱基覆盖的比例;测序序深度与覆盖度之间的关系可以过Lander-WatermanModel(1988)来确定
宫师15098631104：
光纤位移传感器动态位移测试原理 -
67685桂峰
： 光纤位移传感器原理 一:实验原理: 本实验仪中所用的为传光型光纤传感器,光纤在传感器中起到光的传输作用,因此是属于非功能性的光纤传感器.光纤传感器的两支多模光纤分别为光源发射及接收光强之用,其工作原理如图(22)所示....
宫师15098631104：
请问第二代DNA甲基化测序使用什么测序仪 具体原理是什么呢 -
67685桂峰
： 甲基化测序和普通的测序所采用的仪器是一样的,只不过在文库制备过程中多了一步处理,在测序完成之后再来判断哪一位碱基是甲基化的位点,关于第二代测序仪器,建议直接百度,有很多很多介绍
宫师15098631104：
舒尔茨的IMC整合营销核心理论 -
67685桂峰
： 整合营销传播(IntegratedMarketingCommunication,简称IMC),是品牌创建的系统理论和科学方法.它以为核心重组企业行为和市场行为,综合协调使用各种形式的传播手段,以统一的目标和统一的传播形象,传递一致的产品与品牌信息,实现与消费者的双向沟通,从而迅速树立在消费者心目中的地位、构建消费者长期密切的关系,以更有效地实现短期营销目的、建立长期的品牌及股东价值.
宫师15098631104：
求可溶性还原糖,蛋白质和脂肪的鉴定原理 -
67685桂峰
： 1.可溶性还原糖鉴定原理生物组织中普遍存在的可溶性糖类较多,有葡萄糖、果糖、麦芽糖和蔗糖.前三种糖的分子内都含有游离的具还原性的半缩醛羟基,因此叫做还原糖;蔗糖分子内没有,为非还原糖.实验中所用的斐林试剂,只能鉴定...
宫师15098631104：
数码管动态显示工作原理 -
67685桂峰
： 动态显示驱动② 动态显示驱动:数码管动态显示接口是单片机中应用最为广泛的一种显示方式之一,动态驱动是将所有数码管的8个显示笔划＂a,b,c,d,e,f,g,dp＂的同名端连在一起,另外为每个数码管的公共极COM增加位选通控制电路,位选通...
宫师15098631104：
假设检验依据的基本原理 -
67685桂峰
： 假设检验是除参数估计之外的另一类重要的统计推断问题.它的基本思想可以用小概率原理来解释.所谓小概率原理,就是认为小概率事件在一次试验中是几乎不可能发生的.也就是说,对总体的某个假设是真实的,那么不利于或不能支持这一假设的事件A在一次试验中是几乎不可能发一的;要是在一次试验中事件A竟然发生了,我们就有理由怀疑这一假设的真实性,拒绝这一假设.
宫师15098631104：
MPF活性的调控机制和MPF的作用机制 -
67685桂峰
： (1)定义:能促进M期启动的调控因子,在G2/M期转换中起关键作用的蛋白激酶. (2)分子结构:①cdk1:为一种Ser/Thr激酶,可催化蛋白质Ser与Thr残基磷酸化,是MPF的活性单 位,在整个细胞周期进程中的表达均较为恒定. ②cyclinB:具有...
宫师15098631104：
ajax的基本原理是什么 -
67685桂峰
： Ajax的原理简单来说通过XmlHttpRequest对象来向服务器发异步请求,从服务器获得数据,然后用javascript来操作DOM而更新页面.这其中最关键的一步就是从服务器获得请求数据.要清楚这个过程和原理,我们必须对 XMLHttpRequest有所了解.XMLHttpRequest是ajax的核心机制,它是在IE5中首先引入的,是一种支持异步请求的技术.简单的说,也就是javascript可以及时向服务器提出请求和处理响应,而不阻塞用户.达到无刷新的效果.
