graphpad prism 如何做拟合曲线 graphpad prism怎么做生存曲线
\u600e\u4e48\u7528graphpad prism\u62df\u5408\u4f5c\u7269\u751f\u957f\u66f2\u7ebf1stOpt\u66f4\u7b80\u5355\u5bb9\u6613\uff1a
Function y=xm/(1+(xm/x0-1)*exp(-r*x));
Data;
0 0.045
7 0.132
14 0.464
27 1.689
34 2.567
43 5.080
49 6.365
69 10.693
88 12.635
109 17.041
\u5747\u65b9\u5dee(RMSE):0.722744534830643
\u6b8b\u5dee\u5e73\u65b9\u548c(SSE):5.22359662627563
\u76f8\u5173\u7cfb\u6570(R): 0.992488175462493
\u76f8\u5173\u7cfb\u6570\u4e4b\u5e73\u65b9(R^2): 0.985032778432868
\u786e\u5b9a\u7cfb\u6570(DC): 0.98361286192678
\u5361\u65b9\u7cfb\u6570(Chi-Square): 1.30867322055077
F\u7edf\u8ba1(F-Statistic): 213.582138892194
\u53c2\u6570 \u6700\u4f73\u4f30\u7b97
---------- -------------
xm 17.209692849643
x0 0.500004975278111
r 0.0570804068050968
\u6570\u636e\u7684\u683c\u5f0f\u5176\u5b9e\u5f88\u7b80\u5355\uff0c\u4e00\u5171\u4e09\u5217\u3002\u7b2c\u4e00\u5217\uff1a\u89c2\u5bdf\u7684\u65f6\u95f4\uff08\u4e24\u4e2a\u7ec4\u90fd\u5217\u5728\u4e00\u8d77\uff09\u3002\u7b2c\u4e8c\u5217\uff0c\u5bf9\u7167\u7ec4\u89c2\u5bdf\u7ec8\u70b9\u7684\u72b6\u6001\uff08\u6ce8\u610f\u4e0e\u7b2c\u4e00\u5217\u7684\u65f6\u95f4\u5bf9\u5e94\uff09\u3002\u7b2c\u4e09\u5217\uff0c\u8bd5\u9a8c\u7ec4\u89c2\u5bdf\u7ec8\u70b9\u7684\u72b6\u6001\u3002 \u539f\u5219\u5c31\u662f\uff0c\u4e00\u4e2a\u6a2a\u884c\u7684\u6570\u636e\u53ea\u4ee3\u8868\u4e00\u4e2a\u88ab\u89c2\u5bdf\u5bf9\u8c61\uff0c\u800c\u4e0d\u4ee3\u8868\u6574\u4f53\u7684\u60c5\u51b5\uff08\u770b\u4f60\u81ea\u5df1\u5217\u51fa\u7684\u6570\u636e\uff0c\u77e5\u9053\u4f60\u6ca1\u641e\u660e\u767d\u8fd9\u70b9\uff09\u3002 \u4e0b\u9762\u7684\u4f8b\u5b50\u53c2\u8003\u7684\u662f\u4f60\u6700\u521d\u7ed9\u51fa\u7684\u6570\u636e\u3002
1、首先在电脑中打开graphpad prism7.0软件后，点击create，如图所示。
2、然后在title输入组别，下方对应输入数据，先输入第一组数据，如图所示。
3、然后点击analyze，点击ok。
4、接着点击file，点击new data table and graph，点击create。
5、然后输入新数据，如图所示。
6、然后将数据进行ROC分析，就完成了 。
基于GraphPad Prism的批量数据拟合
经常做药理筛选的人会碰到一些基本的数据处理问题，比如每天做50个化合物的IC50。数据在读板机读出数据后，经常面临的大量数据格式转换、数据拟合和IC50的求解。这里以Prism为例说明Prism的全自动数据拟合以及图像输出。
1. 首先请把数据输出成单个.csv文件，以化合物命名，格式如下(例见附件)：
30 100.005 100.05 100.21
10 100.32 100.38 100.11
3.3 88.31 87.555 85.3
1.1 30.98 88.675 89.035
0.37 81.73 78.835 81.085
0.1235 47.735 36.15 30.38
0.0412 14.57 6.845 1.53
0.0137 14.43 4.335 9.19
2. 打开Prism,从File/Run Script/New Script，将以下程序写入：
==========程序在下面============
SetPath G:\Blog\Automatic //缺省文件夹
Open BatchProcessing.pzf //模板文件，例见附件。
ForEach *.csv
Goto D //Go to data table section.
ClearTable //Clear Data from last running.
SetSheetTitle %F //Set the title of the data table to the file name.
Import //Import data.
GoTo G //Go to Graph section.
SetGraphTitle %F //Set the title of the graph to the file name.
SendToPP //Send graph to microsoft powerpoint.
or other figure formats.
Next //Next loop.
Close //Finish up.
==========程序在上面============
保存于比如缺省文件夹内 BatchProcessing.pzc (例见附件)。
3. 双击BatchProcessing.pzc运行即可。
可选项：Prism可以直接将拟合结果输出到文本文件中，或输出图片，还可以配合Excel实现完全自动化处理。
基于GraphPad Prism的批量数据拟合
经常做药理筛选的人会碰到一些基本的数据处理问题，比如每天做50个化合物的IC50。数据在读板机读出数据后，经常面临的大量数据格式转换、数据拟合和IC50的求解。这里以Prism为例说明Prism的全自动数据拟合以及图像输出。
1. 首先请把数据输出成单个.csv文件，以化合物命名，格式如下(例见附件)：
30 100.005 100.05 100.21
10 100.32 100.38 100.11
3.3 88.31 87.555 85.3
1.1 30.98 88.675 89.035
0.37 81.73 78.835 81.085
0.1235 47.735 36.15 30.38
0.0412 14.57 6.845 1.53
0.0137 14.43 4.335 9.19
2. 打开Prism,从File/Run Script/New Script，将以下程序写入：
==========程序在下面============
SetPath G:\Blog\Automatic //缺省文件夹
Open BatchProcessing.pzf //模板文件，例见附件。
ForEach *.csv
Goto D //Go to data table section.
ClearTable //Clear Data from last running.
SetSheetTitle %F //Set the title of the data table to the file name.
Import //Import data.
GoTo G //Go to Graph section.
SetGraphTitle %F //Set the title of the graph to the file name.
SendToPP //Send graph to microsoft powerpoint.
or other figure formats.
Next //Next loop.
Close //Finish up.
==========程序在上面============
保存于比如缺省文件夹内 BatchProcessing.pzc (例见附件)。
3. 双击BatchProcessing.pzc运行即可。
可选项：Prism可以直接将拟合结果输出到文本文件中，或输出图片，还可以配合Excel实现完全自动化处理。
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