分子生物信息数据库的介绍
\u751f\u7269\u4fe1\u606f\u6570\u636e\u5e93\u514d\u8d39\u7684\u751f\u7269\u4fe1\u606f\u6570\u636e\u5e93\uff0c\u6211\u77e5\u9053\u7684\u6709NCBI\uff08\u7f8e\u56fd\u56fd\u7acb\u751f\u7269\u6280\u672f\u4fe1\u606f\u4e2d\u5fc3\uff09\uff0c\u5f88\u6743\u5a01\u3002\u6709\u5173\u751f\u7269\u4fe1\u606f\u6570\u636e\u5e93\uff0c\u6700\u597d\u662f\u8fdb\u4e00\u4e9b\u5b66\u6821\u6216\u8005\u79d1\u7814\u5355\u4f4d\uff0c\u56e0\u4e3a\u4ed6\u4eec\u4e00\u822c\u8981\u4e70\u4e00\u4e9b\u6570\u636e\u5e93\u7684\u3002
\u5373\u643a\u5e26\u6709\u751f\u7269\u4fe1\u606f\u7684\u5206\u5b50\uff0c\u6bd4\u5982\u8bf4DNA\uff0cRNA\u4e4b\u7c7b\u7684\u4ed6\u4eec\u7684\u78b1\u57fa\u5e8f\u5217\u5c31\u4ee3\u8868\u7740\u4ed6\u4eec\u5e26\u6709\u7684\u751f\u7269\u4fe1\u606f\uff0c\u53ef\u4ee5\u7528\u4e8e\u7f16\u7801\u76f8\u5173\u4f5c\u7528\u7684\u86cb\u767d\u4e4b\u7c7b\u7684
分子生物信息数据库种类繁多。归纳起来，大体可以分为4个大类，即基因组数据库、核酸和蛋白质一级结构序列数据库、生物大分子（主要是蛋白质）三维空间结构数据库、以上述3类数据库和文献资料为基础构建的二次数据库。
绛旓細浠嬬粛锛1994骞村缓绔嬩簬鑻卞浗鍓戞ˉ銆傚畠鐨勫墠韬槸浣嶄簬寰峰浗娴峰痉鍫＄殑娆ф床鍒嗗瓙鐢熺墿瀛﹀疄楠屽鐨勪俊鎭湇鍔￠儴闂ㄣ侲BI鎺ュ彈浜嗗師鏉MBL鏁版嵁搴撶殑绠＄悊鍜岀淮鎶わ紝骞朵笖鏄娲插垎瀛愮敓鐗╁缃(EMBnet)鐨勪竴涓壒鍒妭鐐广侲BI寮灞曚簡澶氭柟闈㈢殑鐢熺墿淇℃伅鏈嶅姟鍜岀爺绌躲2銆丒MBnet锛屾娲鍒嗗瓙鐢熺墿瀛︿俊鎭缃戯紙European Molecular Biology Network锛夌綉鍧锛...
绛旓細KEGG 鏄簡瑙ｉ珮绾у姛鑳藉拰鐢熺墿绯荤粺锛堝缁嗚優銆 鐢熺墿鍜岀敓鎬佺郴缁燂級锛屼粠鍒嗗瓙姘村钩淇℃伅锛屽挨鍏舵槸澶у瀷鍒嗗瓙鏁版嵁闆嗙敓鎴愮殑鍩哄洜缁勬祴搴忓拰鍏朵粬楂橀氶噺瀹為獙鎶鏈殑瀹炵敤绋嬪簭鏁版嵁搴撹祫婧愶紝 鐢辨棩鏈含閮藉ぇ瀛︾敓鐗╀俊鎭涓績鐨凨anehisa瀹為獙瀹や簬1995骞村缓绔嬨傛槸鍥介檯鏈甯哥敤鐨鐢熺墿淇℃伅鏁版嵁搴涔嬩竴锛屼互鈥滅悊瑙ｇ敓鐗╃郴缁熺殑楂樼骇鍔熻兘鍜屽疄鐢ㄧ▼搴忚祫婧愬簱鈥...
绛旓細鎴戜竴鑸壘璧勬枡锛屾渶鏂拌祫璁兘鏄埌閭ｉ噷鐨勶紝浠栦滑姣旇緝涓撲笟锛屾潈濞侊紝涔熸瘮杈冨叏闈紝鎶鏈枃妗ｏ紝瑙嗛锛屼骇鍝侀兘铔赴瀵岀殑銆傚勾鏉ュぇ閲忕敓鐗╁瀹為獙鐨勬暟鎹Н绱紝褰㈡垚浜嗗綋鍓嶆暟浠ョ櫨璁＄殑鐢熺墿淇℃伅鏁版嵁搴銆傚畠浠悇鑷寜涓瀹氱殑鐩爣鏀堕泦鍜屾暣鐞嗙敓鐗╁瀹為獙鏁版嵁锛屽苟鎻愪緵鐩稿叧鐨勬暟鎹煡璇佹暟鎹鐞嗙殑鏈嶅姟銆
绛旓細Bioinformatics Institute锛圗BI锛夋槸鐩墠鍥介檯涓婂嚑涓噸瑕鍒嗗瓙鐢熺墿淇℃伅缃戠珯涔嬩竴锛屼綅缃骇钀戒簬鑻卞浗The Wellcome Trust Genome Campus銆侲BI鐨勪换鍔″氨鏄‘淇濆垎瀛愮敓鐗╀笌鍩哄洜浣撶殑鐮旂┒淇℃伅鍙互鍏紑骞朵笖鍏嶈垂鎻愪緵缁欑瀛︾ぞ缇わ紝浠ヤ績杩涚瀛﹁繘姝ャ侲BI鎵鎻愪緵鐨勬湇鍔″寘鎷缓绔/缁存姢鏁版嵁搴銆佹彁渚涘垎瀛愮敓鐗╃浉鍏充俊鎭湇鍔°佹墽琛屽垎瀛愮敓鐗╀笌璁＄畻...
绛旓細1銆侀殢鐫鐢熷懡绉戝鍜屽寲瀛︾殑涓嶆柇鍙戝睍锛屼汉浠鐢熺墿浣撶殑璁ょ煡宸茬粡閫愭笎娣卞叆鍒板井瑙傛按骞炽2銆佷粠鍗曚釜鐨勭敓鐗╀綋鍒板櫒瀹樺埌缁勭粐鍒扮粏鑳烇紝鍐嶄粠缁嗚優缁撴瀯鍒版牳閰稿拰铔嬬櫧鐨鍒嗗瓙姘村钩锛屼汉浠剰璇嗗埌鍙互閫氳繃妫娴嬪垎瀛愭按骞崇殑绾挎х粨鏋勶紙濡傛牳閰稿簭鍒楋級锛屾潵妯悜姣旇緝涓嶅悓鐗╃锛屽悓鐗╃涓嶅悓涓綋锛屽悓涓綋涓嶅悓缁嗚優鎴栦笉鍚岀敓鐞嗭紙鐥呯悊锛夌姸鎬佺殑宸紓銆
绛旓細姣旇緝澶х殑centralized resources涓昏鏈塏CBI锛圢ational Center for Biotechnology Information锛夛紝 EBI锛圗uropean Bioinformatics Institute锛夊拰UCSC锛圲niversity of California Santa Cruz锛塆enome Browser銆備笅闈㈠皢鍒嗗埆浠嬬粛杩欎笁涓渶澶х殑鏁版嵁搴浠ュ強鍏朵粬鐨鐢熺墿淇℃伅瀛︽暟鎹祫婧愩1锛嶯CBI绠浠 NCBI-Genome Database锛氬瓨鍌ㄤ簡鐩墠...
绛旓細鏀堕泦锛岀淮鎶わ紝鐢熺墿淇℃伅瀛鏁版嵁搴鍙互鍒嗕负4澶х被:鍗冲熀鍥犵粍鏁版嵁搴撱佹牳閰稿拰铔嬬櫧璐ㄤ竴绾х粨鏋勬暟鎹簱銆佺敓鐗╁ぇ鍒嗗瓙涓夌淮绌洪棿缁撴瀯鏁版嵁搴撱
绛旓細鐙箟涓婂簲鐢ㄤ俊鎭瀛︾殑鐞嗚銆佹柟娉曞拰鎶鏈紝绠＄悊銆佸垎鏋愬拰鍒╃敤鐢熺墿鍒嗗瓙鏁版嵁銆 鐢熷懡淇℃伅绯荤粺 鐢熺墿鎵澶勭殑鏃剁┖绯荤粺 锛岀墿璐ㄧ郴缁燂紝淇℃伅浼犻掍笌鎺у埗銆傜敓鐗╀俊鎭鏄竴闂ㄦ柊鍏寸殑浜ゅ弶瀛︾锛屾槸鐢熷懡绉戝棰嗗煙涓殑鏂板叴瀛︾锛岄潰瀵逛汉绫诲熀鍥犵粍璁″垝绛夊悇绉嶉」鐩墍浜х敓鐨勫簽澶х殑鍒嗗瓙鐢熺墿瀛︿俊鎭锛岀敓鐗╀俊鎭鐨勯噸瑕佹у皢瓒婃潵瓒婄獊鍑猴紝瀹冨皢浼...
绛旓細鍙戠幇鏂板熀鍥犳槸褰撳墠鍥介檯涓婂熀鍥犵粍鐮旂┒鐨勭儹鐐,浣跨敤鐢熺墿淇℃伅瀛︾殑鏂规硶鏄彂鐜版柊鍩哄洜鐨勯噸瑕佹墜娈点傛瘮濡:鍟ら厭閰垫瘝瀹屾暣鍩哄洜缁勬墍鍖呭惈鐨勭害6000涓熀鍥,澶х害60%鏄氳繃淇℃伅鍒嗘瀽寰楀埌鐨勩 (1)鍩哄洜鐨勭數鑴戝厠闅 鍒╃敤E ST鏁版嵁搴鍙戠幇鏂板熀鍥犱篃琚О涓哄熀鍥犵殑鐢佃剳鍏嬮殕銆 E ST搴忓垪鏄熀鍥犺〃杈剧殑鐭 c DNA搴忓垪,瀹冧滑鎼哄甫鐫瀹屾暣鍩哄洜鐨勬煇浜涚墖娈电殑淇℃伅...
绛旓細鍥介檯涓婄幇鏈4涓ぇ鐨鐢熺墿淇℃伅涓績,鍗崇編鍥界敓鐗╁伐绋嬩俊鎭腑蹇(GenBank)鍜屽熀鍥犵粍搴忓垪鏁版嵁搴(GSDB),娆ф床鍒嗗瓙鐢熺墿瀛鐮旂┒鎵(EMBL)鍜屾棩鏈珼NA鏁版嵁搴(DDBJ)銆傝繖浜涗腑蹇冨拰鍏ㄧ悆鐨勫熀鍥犵粍鐮旂┒瀹為獙瀹ら氳繃缃戠珯銆佺數瀛愰偖浠舵垨鑰呯洿鎺ヤ笌鏈嶅姟鍣ㄥ拰鏁版嵁搴撹仈绯昏岃幏寰楃殑鎼滃绯荤粺,浣垮緱鐮旂┒鑰呭彲浠ュ湪澶氱涓嶅悓鐨勫垎鏋愮郴缁熶腑瀵瑰簭鍒楁暟鎹繘琛屾煡璇,鍒╃敤鍜...
