技术 | 引物和探针的制备方法一览

在生命科学的精密舞台上,引物和探针的制备如同调色盘上的魔法,它们以多种方式确保实验的准确性和可视化。这些关键工具通过化学合成、PCR扩增和重组DNA技术精心打造,每一步都关乎结果的精确性和可靠性。


化学合成的奥秘


化学合成是制备引物和探针的常用手段。从单链的寡核苷酸(19-25个碱基)起,通过磷酰胺合成,每个碱基如同乐高积木般精确构建。关键在于标记,例如FITC、DIG或生物素,它们以11-16个核苷酸间隔巧妙地连接,确保与目标序列的稳定结合,同时不影响后续检测(图1)。


碱基艺术与创新设计

碱基类似物,如LNA,以甲基键嵌入核糖,提供更高的特异性,而图2中的LNA结构揭示了这种创新设计的魅力。它在特定位置增强Tm值,提高杂交稳定性。


PCR探针的多功能性


在PCR扩增中,探针可以通过标记引物或dNTPs进行创建。在PCR产物纯化后,探针的标记可以进一步通过切割和平移,或随机引物添加实现,如图5所示,每一步都精心设计以确保高效和精确的检测。


重组DNA技术的探索

对于长靶点,重组DNA技术则发挥关键作用,通过克隆技术将大片段DNA插入载体,如质粒或噬菌体,确保探针与大目标的完美匹配。这种方法在特定条件下,如需要高分辨率检测时尤为实用(图3)。


效率与精度的平衡


引物和探针的长度与性能息息相关。理想情况下,15-20个核苷酸的寡核苷酸能在保持高效杂交的同时,兼顾一致性。过长的探针可能降低纯度,因此在原位杂交中,通常选择多个短片段而非一个大片段(图4)。


探索与应用的广阔领域

寡核苷酸探针因其长寿命、高纯度和成本效益,广泛应用于实时PCR和常规杂交实验。专业公司提供各种定制选项,无论是有标记或无标记,纯度不同,都确保了科学家们的便利与实验的成功(图5)。



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