如何用GraphPad Prism进行两组连续变量的比较

\u5982\u4f55\u7528GraphPad Prism\u8fdb\u884c\u4e24\u7ec4\u8fde\u7eed\u53d8\u91cf\u7684\u6bd4\u8f83

\u4e24\u7ec4\u8fde\u7eed\u53d8\u91cf\u7684\u6bd4\u8f83\u662f\u4e34\u5e8a\u79d1\u7814\u4e2d\u7ecf\u5e38\u9047\u89c1\u7684\u95ee\u9898\uff0c\u6bd4\u5982\u6bd4\u8f83\u8bd5\u9a8c\u7ec4\u548c\u5bf9\u7167\u7ec4\u7684\u5e74\u9f84\u662f\u5426\u76f8\u540c\u3002\u5bf9\u4e8e\u6b64\u7c7b\u6570\u636e\u7684\u5206\u6790\uff0c\u9996\u5148\u5e94\u770b\u518d\u8bd5\u9a8c\u8bbe\u8ba1\u4e0a\u662f\u5426\u8fdb\u884c\u4e86\u914d\u5bf9\uff0c\u4e4b\u540e\u518d\u770b\u6570\u636e\u662f\u5426\u5448\u6b63\u6001\u5206\u5e03\uff0c\u65b9\u5dee\u662f\u5426\u9f50\u3002\u5bf9\u4e8e\u6b64\u7c7b\u6570\u636e\u7684\u6570\u636e\uff0c\u5927\u81f4\u53ef\u4ee5\u9075\u5faa\u56fe1\u6240\u793a\u7684\u539f\u5219\u3002
\u6bd4\u8f83\u65b9\u6cd5\uff1a\u5982\u679c\u6570\u636e\u662f\u8fde\u7eed\u6027\u6570\u636e\uff0c\u4e14\u4e24\u7ec4\u6570\u636e\u5206\u522b\u670d\u4ece\u6b63\u6001\u5206\u5e03&\u65b9\u5dee\u9f50\uff08\u65b9\u5dee\u9f50\u6027\u68c0\u9a8c\uff09\uff0c\u5219\u53ef\u4ee5\u91c7\u7528t\u68c0\u9a8c\uff0c\u5982\u679c\u4e0d\u670d\u4ece\u4ee5\u4e0a\u6761\u4ef6\u53ef\u4ee5\u91c7\u7528\u79e9\u548c\u68c0\u9a8c\u3002

\u6269\u5c55\u8d44\u6599\uff1a
\u5bf9\u4e8e\u5904\u7406\u503c\u7684\u5206\u5e03\u548c\u6570\u636e\u70b9\u7684\u5206\u7c07\uff0c\u6563\u70b9\u56fe\u90fd\u5f88\u7406\u60f3\u3002\u5982\u679c\u6570\u636e\u96c6\u4e2d\u5305\u542b\u975e\u5e38\u591a\u7684\u70b9\uff08\u4f8b\u5982\uff0c\u51e0\u5343\u4e2a\u70b9\uff09\uff0c\u90a3\u4e48\u6563\u70b9\u56fe\u4fbf\u662f\u6700\u4f73\u56fe\u8868\u7c7b\u578b\u3002\u5728\u70b9\u72b6\u56fe\u4e2d\u663e\u793a\u591a\u4e2a\u5e8f\u5217\u770b\u4e0a\u53bb\u975e\u5e38\u6df7\u4e71\uff0c\u8fd9\u79cd\u60c5\u51b5\u4e0b\uff0c\u5e94\u907f\u514d\u4f7f\u7528\u70b9\u72b6\u56fe\uff0c\u800c\u5e94\u8003\u8651\u4f7f\u7528\u6298\u7ebf\u56fe\u3002
\u9ed8\u8ba4\u60c5\u51b5\u4e0b\uff0c\u6563\u70b9\u56fe\u4ee5\u5706\u5708\u663e\u793a\u6570\u636e\u70b9\u3002\u5982\u679c\u5728\u6563\u70b9\u56fe\u4e2d\u6709\u591a\u4e2a\u5e8f\u5217\uff0c\u8bf7\u8003\u8651\u5c06\u6bcf\u4e2a\u70b9\u7684\u6807\u8bb0\u5f62\u72b6\u66f4\u6539\u4e3a\u65b9\u5f62\u3001\u4e09\u89d2\u5f62\u3001\u83f1\u5f62\u6216\u5176\u4ed6\u5f62\u72b6\u3002
\u53c2\u8003\u8d44\u6599\u6765\u6e90\uff1a\u767e\u5ea6\u767e\u79d1-\u6563\u70b9\u56fe

Standard Error of Mean \u6807\u51c6\u8bef\uff0c\u5373\u6837\u672c\u5747\u6570\u7684\u6807\u51c6\u5dee\uff0c\u662f\u63cf\u8ff0\u5747\u6570\u62bd\u6837\u5206\u5e03\u7684\u79bb\u6563\u7a0b\u5ea6\u53ca\u8861\u91cf\u5747\u6570\u62bd\u6837\u8bef\u5dee\u5927\u5c0f\u7684\u5c3a\u5ea6\uff0c\u53cd\u6620\u7684\u662f\u6837\u672c\u5747\u6570\u4e4b\u95f4\u7684\u53d8\u5f02\u3002\u6807\u51c6\u8bef\u4e0d\u662f\u6807\u51c6\u5dee\uff0c\u662f\u591a\u4e2a\u6837\u672c\u5e73\u5747\u6570\u7684\u6807\u51c6\u5dee\u3002 \u6807\u51c6\u8bef\u7528\u6765\u8861\u91cf\u62bd\u6837\u8bef\u5dee\u3002

两组连续变量的比较是临床科研中经常遇见的问题,比如比较试验组和对照组的年龄是否相同。对于此类数据的分析,首先应看再试验设计上是否进行了配对,之后再看数据是否呈正态分布,方差是否齐。对于此类数据的数据,大致可以遵循图1所示的原则。

图1 两组变量变量比较的原则

可以用于两组资料比较的软件很多,比如SPSS,SAS和Stata等功能强大的专业统计软件。但笔者更倾向于用GraphPad
Prism,因为该软件操作简单,结果更容易解读。实际上,在临床科研中遇到的绝大部分统计问题,都可以通过GraphPad
Prism来解决。GrapgPad Prism是一款侧重于科学绘图的软件,但其同事具备简单的统计学功能。本文所采用GraphPad
Prism为6.0版本,其他版本的操作与此类似。该软件的安装教程在网上均可找到,在此不再赘述。本文仅简单演示如何在GraphPad
Prism进行两组连续变量的比较。

1

数据的录入

打开GraphPad Prism软件后,软件会让操作者选择数据的输入类型,此时注意选择“Column”这个选项。如图2所示:

图2:数据类型的选择

之后分别输入两组变量的值。如图3所示,实验组共5个样本,检测数值分别为1,2,3,4和5;对照组也是5个样本,分别是4,5,6,7和8。也可以在表头上对数据进行标识,分别为Experiments和Controls。如果此处不进行标识,默认的组名是Dataset
A和Dataset B。

图3 在GraphPad Prism中录入结果

2

结果的运算

结果录入完毕后,点击菜单栏中的Analyze,会出现如图4所示的界面。注意左侧一定要选中”t tests (and
nonparametric tests)”。

图4 选择统计方法

点击图4中的OK,会进入如图5所示界面。在此界面中,软件要求作者选择是否配对(Paired和Unpaired),并决定选择参数检验还是非参数检验。所谓参数检验就是指配对t检验或独立样本t检验,而非参数检验则是指Mann-Whitney
U检验或配对Wilcoxon检验。如果选择参数检验(默认两组数据均呈正态分布),软件会让操作者选择方差是否齐。

如果方差齐,软件会选择t检验,如果不齐,软件推荐Welch法。需要说明的一点是,如果两组数据均呈正太分布,但方差不齐,此时应采用校正t检验,目前有三种主要的校正t检验法:Cochran
& Cox法、Satterthwait法和Welch法。GraphPad
Prism仅支持Welch法。

如果两组数据不呈正太分布,则应该选用非参数检验。非参数的两个选项分别是Mann-Whitney
U检验和Kolmogorov-Smirnov检验。一般选择Mann-Whitney U检验。

图5
选择统计方法

除了Experimental
Design以外,还可以对Optional选项里面的内容进行修改。如图6所示。一般建议选择“Discreptive
statistics for each data set”(展示各组数据的均数、中位数、标准差、秩和等)选项。在P
value一段,系统默认为双尾检验,一般建议不要更改。

图6 统计选项

所有的选项选择完毕后,点击OK即可进行计算。

3

结果的解读

结果一般分为两个部分,一是差异是否具有统计学意义;二是差异有多大。如果研究者选择了Mann-Whitney
U检验,则可得到如图7所示的结果。

图7 非参数分析结果的解读

参数分析结果的解读与此类似,只不过多了个F test to compare
variances,即方差是否齐。一般认为,P值大于0.10才可以认为两组数据方差相同(注意:是“大于”,不是“小于”!是“0.10”,不是“0.05”!!!!)。

4

检验数据是否呈正态分布

可能有的读者会问GraphPad
Prism能否判断数据是否呈正态分布。其实是可以进行正态分布检验的。以上述两组数据为例,首先点击Analyze,然后选择XY
Analysis下面的Column statistics。如图8所示:

图8 进行正态分布检验

如图9所示,GraphPad
Prism提供了三种检验数据是否呈正态分布的方法:D’Agootino-Pearson法,Kolmogorov-Smirnov法和Shapiro-Wilk法。针对同一种数据,三种方法的计算结果大同小异。虽然GraphPad
Prism不推荐用Kolmogorov-Smirnov法,但根据笔者经验,在国际上发表论文时,多采用Kolmogorov-Smirnov法的结果,可能是因为当样本量太小时,Shapiro-Wilk法和D’Agootino-Pearson法无法给出检验结果。当然,也可以三种方法都选择,综合判断数据是否呈正态分布。

图9 进行正态分布检验(第二步)

选择好统计方法之后点击OK,就可以得到正态检验的结果,如图10所示。需要特别说明的是:在正态检验中,一般认为P大于0.10才表述数据呈正态分布(注意:是“大于”,不是“小于”!是0.10,不是“0.05”!!!!)。在本案例中,两组数据的P值均为0.20,因此可以认为两组数据均呈正态分布。

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