如何从细胞中提取dna 单个细胞的DNA怎么提取

\u7ec6\u80deDNA\u7684\u63d0\u53d6\u4e00\u822c\u7528\u4ec0\u4e48\u65b9\u6cd5

\u9ad8\u4e2d\uff1a\u539f\u7406\uff1a 1.\u6790\u51fa\u6eb6\u89e3\u5728NaC1\u6eb6\u6db2\u4e2d\u7684DNA\u3002 2.\u7528\u51b7\u9152\u7cbe\u63d0\u53d6\u51fa\u542b\u6742\u8d28\u8f83\u5c11\u7684DNA\u3002 3.DNA\u5728\u6cb8\u6c34\u6d74\u65f6\u88ab\u4e8c\u82ef\u80fa\u67d3\u6210\u84dd\u8272\u3002\u65b9\u6cd5\u6b65\u9aa4\uff1a 1\uff0e\u63d0\u53d6\u7ec6\u80de\u6838\u7269\u8d28\uff1a\u987a\u65f6\u9488\u65b9\u5411\u6405\u62cc\uff0c\u7a0d\u5feb\uff0c\u7a0d\u91cd\u3002 5 min 2\uff0e\u6eb6\u89e3DNA\uff1a 3\uff0e\u6790\u51fa\u542bDNA\u7684\u9ecf\u7a20\u7269\uff1a\u84b8\u998f\u6c34300mL\uff0c\u9006\u65f6\u9488\u65b9\u5411\u6405\u62cc\uff0c\u7f13\u6162 4\uff0e\u8fc7\u6ee4\uff1a\u53d6\u9ecf\u7a20\u7269 5\uff0e\u518d\u6eb6\u89e3\uff1a\u987a\u65f6\u9488\u65b9\u5411\u6405\u62cc\uff0c\u8f83\u6162\u30023 min 6\uff0e\u8fc7\u6ee4\uff1a\u53d6\u6ee4\u6db2\u3002 7\uff0e\u63d0\u53d6\u51fa\u542b\u6742\u8d28\u8f83\u5c11\u7684DNA\uff0c\u9006\u65f6\u9488\u65b9\u5411\u6405\u62cc\uff0c\u7a0d\u6162\u30025 min 8\uff0eDNA\u7684\u9274\u5b9a\uff1a\u6cb8\u6c34\u6d745min \u5927\u5b66 DNA\u63d0\u53d6\u5206\u4e3a\u4e09\u4e2a\u57fa\u672c\u6b65\u9aa4\uff0c\u6bcf\u4e2a\u6b65\u9aa4\u7684\u5177\u4f53\u65b9\u6cd5\u53ef\u6839\u636e\u6837\u54c1\u79cd\u7c7b\u3001\u5f71\u54cd\u63d0\u53d6\u7684\u7269\u8d28\u4ee5\u53ca\u540e\u7eed\u6b65\u9aa4\u7684\u4e0d\u540c\u800c\u6709\u533a\u522b\u3002\u5229\u7528\u7814\u78e8\u6216\u8005\u8d85\u58f0\u7834\u788e\u7ec6\u80de\uff0c\u5e76\u901a\u8fc7\u52a0\u5165\u53bb\u6c61\u5242\u4ee5\u9664\u6389\u819c\u8102\u3002\u52a0\u5165\u86cb\u767d\u9176\uff0c\u918b\u9178\u76d0\u6c89\u6dc0\uff0c\u6216\u8005\u915a/\u6c2f\u4eff\u62bd\u63d0\uff0c\u4ee5\u9664\u6389\u7ec6\u80de\u5185\u7684\u86cb\u767d\uff0c\u5982\u4e0eDNA\u7ed3\u5408\u7684\u7ec4\u86cb\u767d\u3002\u5c06DNA\u5728\u51b7\u4e59\u9187\u6216\u5f02\u4e19\u9187\u4e2d\u6c89\u6dc0\uff0c\u56e0\u4e3aDNA\u5728\u9187\u4e2d\u4e0d\u53ef\u6eb6\u800c\u9ecf\u5728\u4e00\u8d77\uff0c\u8fd9\u4e00\u6b65\u4e5f\u80fd\u9664\u6389\u76d0\u5206\u3002\u53e6\u5916\uff0c\u76ee\u524d\u4e5f\u6709\u5229\u7528\u5438\u9644\u8fc7\u67f1\u7684\u65b9\u6cd5\u63d0\u53d6DNA\u7684\u5546\u4e1a\u5316\u8bd5\u5242\u76d2\u3002 2.\u7ec6\u80de\u7684\u7834\u788e\u7ec6\u83cc\u6709\u575a\u786c\u7684\u7ec6\u80de\u58c1\uff0c\u9996\u5148\u8981\u7834\u788e\u7ecf\u80de\u3002\u65b9\u6cd5\u6709\u4e09\u79cd;\u2460\u673a\u68b0\u65b9\u6cd5\uff1a\u8d85\u58f0\u6ce2\u5904\u7406\u6cd5\u3001\u7814\u78e8\u6cd5\u3001\u5300\u6d46\u6cd5;\u2461\u5316\u5b66\u8bd5\u5242\u6cd5\uff1a\u7528SDS\u5904\u7406\u7ec6\u80de;\u2462\u9176\u89e3\u6cd5\uff1a\u52a0\u5165\u6eb6\u83cc\u9176\u6216\u8717\u725b\u9176\uff0c\u90fd\u53ef\u4f7f\u7ec6\u80de\u58c1\u7834\u788e\u3002 3.DNA\u63d0\u53d6\u7684\u51e0\u79cd\u65b9\u6cd5 (1).\u6d53\u76d0\u6cd5 A. \u5229\u7528RNA\u548cDNA\u5728\u7535\u89e3\u6eb6\u6db2\u4e2d\u6eb6\u89e3\u5ea6\u4e0d\u540c\uff0c\u5c06\u4e8c\u8005\u5206\u79bb\uff0c\u5e38\u7528\u7684\u65b9\u6cd5\u662f\u75281M \u6c2f \u7eb3\u63d0\u53d6\u5316\u94a0\u62bd\u63d0,\u5f97\u5230\u7684DNP\u7c98\u6db2\u4e0e\u542b\u6709\u5c11\u91cf\u8f9b\u9187\u7684 \u6c2f\u4eff\u4e00\u8d77\u6447\u8361,\u4f7f\u4e73\u5316,\u518d\u79bb\u5fc3\u9664\u53bb\u86cb\u767d\u8d28,\u6b64\u65f6\u86cb\u767d\u8d28\u51dd\u80f6\u505c\u7559\u5728\u6c34\u76f8\u53ca\u6c2f\u4eff\u76f8\u4e2d\u95f4\uff0c\u800cDNA\u4f4d\u4e8e\u4e0a\u5c42\u6c34\u76f8\u4e2d,\u75282\u500d\u4f53\u79ef95%\u4e59\u9187\u53ef\u5c06DNA \u94a0\u76d0\u6c89\u6dc0\u51fa\u6765. B. \u4e5f\u53ef\u75280.15 MNaCL\u6db2\u53cd\u590d\u6d17\u6da4\u7ec6\u80de\u7834\u788e\u6db2\u9664\u53bbRNP,\u518d\u4ee51MNaCL\u63d0\u53d6\u8131\u6c27\u6838\u7cd6\u86cb\u767d,\u518d\u6309\u6c2f\u4eff---\u5f02\u9187\u6cd5\u9664\u53bb\u86cb\u767d. \u4e24\u79cd\u65b9\u6cd5\u6bd4\u8f83,\u540e\u79cd\u65b9\u6cd5\u4f7f\u6838\u9178\u964d\u89e3\u53ef\u80fd\u5c11\u4e00\u4e9b. C.\u4ee5\u7a00\u76d0\u9178\u6eb6\u6db2\u63d0\u53d6DNA \u65f6,\u52a0\u5165\u9002\u91cf\u53bb\u6c61\u5242,\u5982SDS\u53ef\u6709\u52a9\u4e8e\u86cb\u767d\u8d28\u4e0eDNA \u7684\u5206\u79bb\u3002\u5728\u63d0\u53d6\u8fc7\u7a0b\u4e2d\u4e3a\u6291\u5236\u7ec4\u7ec7\u4e2d\u7684DNase\u5bf9DNA \u7684\u964d\u89e3\u4f5c\u7528,\u5728\u6c2f\u5316\u94a0\u6eb6\u6db2\u4e2d\u52a0\u5165\u67e0\u6aac\u9178\u94a0\u4f5c\u4e3a\u91d1\u5c5e\u79bb\u5b50\u7684\u70d9\u5408\u5242.\u901a\u5e38\u7528.15MNaCL,0.015M\u67e0\u6aac\u94a0,\u5e76\u79f0SSC\u6eb6\u6db2,\u63d0\u53d6DNA. \uff082\uff09.\u9634\u79bb\u5b50\u53bb\u6c61\u5242\u6cd5; \u7528SDS\u6216\u4e8c\u7532\u82ef\u9178\u94a0\u7b49\u53bb\u6c61\u5242\u4f7f\u86cb\u767d\u8d28\u53d8\u6027,\u53ef\u4ee5\u76f4\u63a5\u4ece\u751f\u7269\u6750\u6599\u4e2d\u63d0\u53d6DNA .\u7531\u4e8e\u7ec6\u80de\u4e2dDNA\u4e0e\u86cb\u767d\u8d28\u4e4b\u95f4\u5e38\u501f\u9759\u7535\u5f15\u529b\u6216\u914d\u4f4d\u952e\u7ed3\u5408,\u56e0\u4e3a\u9634\u79bb\u5b50\u53bb\u6c61\u5242\u80fd\u591f\u7834\u574f\u8fd9\u79cd\u4ef7\u952e,\u6240\u4ee5\u5e38\u7528\u9634\u79bb\u5b50\u53bb\u6c61\u5242\u63d0\u53d6DNA \uff083\uff09.\u82ef\u915a\u62bd\u63d0\u6cd5\uff1a\u82ef\u915a\u4f5c\u4e3a\u86cb\u767d\u53d8\u6027\u5242,\u540c\u65f6\u6291\u5236\u4e86DNase\u7684\u964d\u89e3\u4f5c\u7528.\u7528\u82ef\u915a\u5904\u7406\u5300\u6d46\u6db2\u65f6,\u7531\u4e8e\u86cb\u767d\u4e0eDNA \u8054\u7ed3\u952e\u5df2\u65ad,\u86cb\u767d\u5206\u5b50\u8868\u9762\u53c8\u542b\u6709\u5f88\u591a\u6781\u6027\u57fa\u56e2\u4e0e\u82ef\u915a\u76f8\u4f3c\u76f8\u6eb6\u3002\u86cb\u767d\u5206\u5b50\u6eb6\u4e8e\u915a\u76f8\uff0c\u800cDNA\u6eb6\u4e8e\u6c34\u76f8\u3002\u79bb\u5fc3\u5206\u5c42\u540e\u53d6\u51fa\u6c34\u5c42\uff0c\u591a\u6b21\u91cd\u590d\u64cd\u4f5c\uff0c\u518d\u5408\u5e76\u542bDNA \u7684\u6c34\u76f8\uff0c\u5229\u7528\u6838\u9178\u4e0d\u6eb6\u4e8e\u9187\u7684\u6027\u8d28\uff0c\u7528\u4e59\u9187\u6c89\u6dc0DNA \u3002\u6b64\u65f6DNA\u662f\u5341\u5206\u7c98\u7a20\u7684\u7269\u8d28\uff0c\u53ef\u7528\u73bb\u7483\u6f2b\u6f2b\u7ed5\u6210\u4e00\u56e2\uff0c\u53d6\u51fa\u3002\u6b64\u6cd5\u7684\u7279\u70b9\u662f\u4f7f\u63d0\u53d6\u7684DNA\u4fdd\u6301\u5929\u7136\u72b6\u6001\uff084\uff09.\u6c34\u62bd\u63d0\u6cd5:\u5229\u7528\u6838\u9178\u6eb6\u89e3\u4e8e\u6c34\u7684\u6027\u8d28,\u5c06\u7ec4\u7ec7\u7ec6\u80de\u7834\u788e\u540e,\u7528\u4f4e\u76d0\u6eb6\u6db2\u9664\u53bbRNA\uff0c\u7136\u540e\u5c06\u6c89\u6dc0\u6eb6\u4e8e\u6c34\u4e2d\uff0c\u4f7fDNA\u5145\u5206\u6eb6\u89e3\u4e8e\u6c34\u4e2d,\u79bb\u5fc3\u540e\u6536\u96c6\u4e0a\u6e05\u6db2.\u5728\u4e0a\u6e05\u4e2d\u52a0\u5165\u56fa\u4f53\u6c2f\u5316\u94a0\u8c03\u8282\u81f32.6M.\u52a0\u51652\u500d\u4f53\u79ef95%\u4e59\u9187,\u7acb\u5373\u7528\u6405\u62cc\u6cd5\u6405\u51fa.\u7136\u540e\u5206\u522b\u752866% \uff0c80%\u548c95%\u4e59\u9187\u4ee5\u53ca\u4e19\u94dc\u6d17\u6da4,\u6700\u540e\u5728\u7a7a\u6c14\u4e2d\u5e72\u71e5,\u65e2\u5f97DNA\u6837\u54c1.\u6b64\u6cd5\u63d0\u53d6\u7684DNA\u4e2d\u86cb\u767d\u8d28\u542b\u91cf\u8f83\u9ad8,\u6545\u4e00\u822c\u4e0d\u7528.\u4e3a\u9664\u86cb\u767d\u53ef\u5c06\u6b64\u6cd5\u52a0\u4ee5\u6539\u826f,\u5728\u63d0\u53d6\u8fc7\u7a0b\u4e2d\u52a0\u5165SDS.

\u539f\u7406\uff1a
1.\u6790\u51fa\u6eb6\u89e3\u5728NaCl\u6eb6\u6db2\u4e2d\u7684DNA\u3002
2.\u7528\u51b7\u9152\u7cbe\u63d0\u53d6\u51fa\u542b\u6742\u8d28\u8f83\u5c11\u7684DNA\u3002
3.DNA\u5728\u6cb8\u6c34\u6d74\u65f6\u88ab\u4e8c\u82ef\u80fa\u67d3\u6210\u84dd\u8272\u3002
\u65b9\u6cd5\u6b65\u9aa4\uff1a
1\uff0e\u63d0\u53d6\u7ec6\u80de\u6838\u7269\u8d28\uff1a\u987a\u65f6\u9488\u65b9\u5411\u6405\u62cc\uff0c\u7a0d\u5feb\uff0c\u7a0d\u91cd\u3002 5 min
2\uff0e\u6eb6\u89e3DNA\uff1a
3\uff0e\u6790\u51fa\u542bDNA\u7684\u9ecf\u7a20\u7269\uff1a\u84b8\u998f\u6c34300mL\uff0c\u9006\u65f6\u9488\u65b9\u5411\u6405\u62cc\uff0c\u7f13\u6162
4\uff0e\u8fc7\u6ee4\uff1a\u53d6\u9ecf\u7a20\u7269
5\uff0e\u518d\u6eb6\u89e3\uff1a\u987a\u65f6\u9488\u65b9\u5411\u6405\u62cc\uff0c\u8f83\u6162\u30023 min
6\uff0e\u8fc7\u6ee4\uff1a\u53d6\u6ee4\u6db2\u3002
7\uff0e\u63d0\u53d6\u51fa\u542b\u6742\u8d28\u8f83\u5c11\u7684DNA\uff0c\u9006\u65f6\u9488\u65b9\u5411\u6405\u62cc\uff0c\u7a0d\u6162\u30025 min
8\uff0eDNA\u7684\u9274\u5b9a\uff1a\u6cb8\u6c34\u6d745min

提取基因组DNA和细胞核DNA是不同的方法
提取细胞核要先把细胞破碎分离出细胞核,要在甘油或其他保护剂中进行
SDS十二烷基磺酸钠:可破坏细胞膜、核膜,并使组织蛋白与DNA分离
CATB是一种抽提液,破坏细胞膜的~具体忘了~
DNA不溶于异丙醇,异丙醇可以析出DNA,产生白色絮状沉淀,用枪头挑出就可以了
以下是一些具体方法,希望有用
基因组DNA提取方法

制备基因组DNA是进行基因结构和功能研究的重要步骤,通常要求得到的片段的长度不小于100-200kb。在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素,以保证DNA的完整性,为后续的实验打下基础。主要是CTAB方法,其他的方法还有1物理方式:玻璃珠法,超声波法,研磨法,冻融法。2化学方式:异硫氰酸胍法,碱裂解法3生物方式:酶法。根据核酸分离纯化方式的不同有:硅质材料、阴离子交换树脂等

试验步骤:

1、贴壁细胞用胰酶消化,离心收集。

2、细胞重悬于冰冷的PBS漂洗一次,离心收集。试验步骤2再重新作一边。

3、加入5mlDNA提取缓冲液,(10mmol/LTris-cl,0.1mol/LEDTA,o.5%SDS),混匀。

4、加入25ul蛋白酶K,使终浓度达到100ug/ml,混匀,50℃水浴3h,

5、用等体积的酚抽提一次,2500rpm离心收集水相,用等体积的(酚,氯仿,异戊醇)混合物抽提一次,2500r/min离心收集水相

6、用等体积的氯仿,异戊醇抽提一次。加入等体积的5mol/L的LiCL,混匀,冰浴,10min.。

7、2500rpm离心10min.转上清于一离心管中。加入等体积的异丙醇。室温10min。

2500rpm,离心10min。弃上清。

8、加入0.1倍体积3mol/L乙酸钠(PH5.2)与2倍体积-20℃预冷无水乙醇。-20℃20min。

9、12000r/min,室温离心5min。弃上清。将DNA溶于适量TE中。

外周血DNA提取技术

分离外周血白细胞提取方法:

试验步骤:

1、取人肘静脉血5ml,EDTA抗凝,2500rpm离心10min。

2、小心吸取上层血浆,分装到3个0.5ml离心管中。

3、在血细胞中加入3倍体积的溶血液,摇匀,冰浴15min。

4、2500rpm离心10min,弃上清。

5、加入10ml溶血液,摇匀,冰浴15min。

6、3000rpm离心10min,弃上清。

7、倒置离心管,去掉残液。

8、得白细胞,-80?C冻存。

试验要求:

血至分离白细胞之间隔时间在室温下放置不超过2h,4℃放置不超过5h,以防白细胞自溶。

氯仿法抽提外周血白细胞基因组DNA:

试验试剂:

Ligsisbuffer:

133mMNH4ClNHCl7.12g0.9mMNH4HCO3NH4HCO30.071g0.1mMEDTA0.5mMEDTA0.2ml;最后加灭菌去离子水至1000ml,高压灭菌。

ACD抗凝剂:柠檬酸1.68g柠檬酸钠4.62g葡萄糖5.15g;最后加灭菌去离子水至350ml,高压灭菌。

提取缓冲液(Extractionbuffer):

10mMTrisCl(PH=8.0)1MTris.Cl(PH=8.0)1ml0.1mMEDTA(PH=8.0)0.5mMEDTA(PH=8.0)20ml0.5%SDS10%SDS0.5ml;最后加灭菌去离子水至100ml,高压灭菌

试验步骤:

1、在500μl抗凝血中加入ligsisbuffer1000μl,充分颠混至清亮。以4000rpm,离心5min。弃上清液。

2、沉淀中加入ligsisbuffer1500μl,充分匀浆。以6000rpm,离心5min。

3、彻底弃去上清,加入extractionbuffer500μl(裂解细胞),混匀置于37℃,水溶1h。

4、加入8μl的蛋白酶K,颠混,37℃过夜(或55℃,3h,但是37℃效果要好些)。

5、每管加入450μl饱和酚(取溶液下层)缓慢摇晃10min,以5500rpm,离心15min。

6、取上清,每管加入250μl饱和酚和250μl氯仿-异戊醇,摇匀10min,以5500rpm,离心15min。

7、取上清,每管加入500μl氯仿-异戊醇,摇匀10min,以5500rpm,离心15min。

8、取上清,每管加50μl的3M的NaAC+,适量无水乙醇(预冷)至满,摇匀放入-20℃保存2h以上。

9、以12000rpm,离心20min。去上清,加入70%乙醇500μl,以12000rpm,离心5min,去上清,50-60℃干燥。

10、加入50μl灭菌去离子水,转弹,混匀。

NaI提取法提取外周血白细胞基因组:

实验步骤:

1、取外周抗凝血(全血)100ul于eppendorf管中,12000rpm离心12min。

2、弃上清,加双蒸水200ul溶解,摇匀20s。

3、混匀后加6MNaI溶液200ul,摇匀20s。

4、加入氯仿/异戊醇(24:1)400ul,边加边摇,摇匀20s,12000rpm离心12min。

5、取上层液350ul,加入另一新eppendorf管中,加0.6倍体积异丙醇,摇匀20s,室温放置15min,静置后的反应体系15000rpm离心12min,使沉淀紧贴eppendorf管壁。

6、弃异丙醇,加70%乙醇1ml(不振动),以15000rpm离心12min。

7、弃乙醇,敞开eppendorf管盖,烘干(37℃恒温箱)后,加1xTE溶液30ul,溶解DNA>12h以上,制成的DNA液-20℃冰箱保存备用。

常用的外周血白细胞基因提取方法:

试验原理:

苯酚/氯仿提取DNA是利用酚是蛋白质的变性剂,反复抽提,使蛋白质变性,SDS(十二烷基磺酸钠)将细胞膜裂解,在蛋白酶K、EDTA的存在下消化蛋白质或多肽或小肽分子,核蛋白变性降解,使DNA从核蛋白中游离出来。DNA易溶于水,不溶于有机溶剂。蛋白质分子表面带有亲水基团,也容易进行水合作用,并在表面形成一层水化层,使蛋白质分子能顺利地进入到水溶液中形成稳定的胶体溶液。当有机溶液存在时,蛋白质的这种胶体稳定性遭到破坏,变性沉淀。离心后有机溶剂在试管底层(有机相),DNA存在于上层水相中,蛋白质则沉淀于两相之间。酚-氯仿抽提的作用是除去未消化的蛋白质。氯仿的作用是有助于水相与有机相分离和除去DNA溶液中的酚。抽提后的DNA溶液用2倍体积的无水乙醇在1/103mol/LNaCl存在下沉淀DNA,回收DNA用70%乙醇洗去DNA沉淀中的盐,真空干燥,用TE缓冲液溶解DNA备用。

试验步骤:

1、将1mlEDTA抗凝贮冻血液于室温解冻后移入5ml离心管中,加入1ml磷酸缓冲盐溶液(PBS),混匀,3500rpm离心15min,倾去含裂解红细胞的上清。重复一次。用0.7mlDNA提取液混悬白细胞沉淀,37℃水浴温育1h。

2、将上述DNA提取液混悬白细胞,37℃水浴温育1h后,加入1mg/ml蛋白酶K0.2ml,至终浓度为100-200ug/ml,上下转动混匀,液体变粘稠。50℃水浴保温3h,裂解细胞,消化蛋白。保温过程中,应不时上下转动几次,混匀反应液。

3、反应液冷却至室温后,加入等体积的饱和酚溶液,温和地上下转动离心管5-10min,直至水相与酚相混匀成乳状液。5000rpm离心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。重复酚抽提一次。加等体积的氯仿:异戊醇(24:1),上下转动混匀,5000rpm离心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。重复一次。

4、加入1/5体积的3mol/LNaAc及2倍体积的预冷的无水乙醇,室温下慢慢摇动离心管,即有乳白色云絮状DNA出现。用玻璃棒小心挑取云絮状的DNA,转入另一1.5ml离心管中,加70%乙醇0.2ml,以5000rpm离心5min。洗涤DNA,弃上清,去除残留的盐。重复一次。室温挥发残留的乙醇,但不要让DNA完全干燥。加TE液20ul溶解DNA,置于摇床平台缓慢摇动,DNA完全溶解通常需12-24h。制成的DNA液-20℃冰箱保存备用。

真核细胞DNA的制备

一般真核细胞基因组DNA有107-9bp,可以从新鲜组织、培养细胞或低温保存的组织细胞中提取,常是采用在EDTA以及SDS等试剂存在下用蛋白酶K消化细胞,随后用酚抽提而实现的。这一方法获得的DNA不仅经酶切后可用于Southern分析,还可用于PCR的模板、文库构建等实验。

根据材料来源不同,采取不同的材料处理方法,而后的DNA提取方法大体类似,但都应考虑以下两个原则:

1、防止和抑制DNase对DNA的降解。

2、尽量减少对溶液中DNA的机械剪切破坏。

试剂准备:

1、TE:10mMTris-HCl(pH7.8);1mMEDTA(pH8.0)。

2、TBS:25mMTris-HCl(pH7.4);200mMNaCl;5mMKCl。

3、裂解缓冲液:250mMSDS;使用前加入蛋白酶K至100mg/ml。

4、20%SDS

5、2mg/ml蛋白酶K

6、Tris饱和酚(pH8.0)、酚/氯仿(酚∶氯仿=1∶1)、氯仿

7、无水乙醇、75%乙醇

试验步骤:

材料处理:

1、新鲜或冰冻组织处理:

1)取组织块0.3-0.5cm3,剪碎,加TE0.5ml,转移到匀浆器中匀浆。

2)将匀浆液转移到1.5ml离心管中。

3)加20%SDS25ml,蛋白酶K(2mg/ml)25ml,混匀。

4)60°C水浴1-3hr。

2、培养细胞处理:

1)将培养细胞悬浮后,用TBS洗涤一次。

2)离心4000g×5min,去除上清液。

3)加10倍体积的裂解缓冲液。

4)50-55°C水浴1-2hr。

DNA提取:

1、加等体积饱和酚至上述样品处理液中,温和、充分混匀3min。

2、离心5000g×10min,取上层水相到另一1.5ml离心管中。

3、加等体积饱和酚,混匀,离心5000g×10min,取上层水相到另一管中。

4、加等体积酚/氯仿,轻轻混匀,离心5000g×10min,取上层水相到另一管中。如水相仍不澄清,可重复此步骤数次。

5、加等体积氯仿,轻轻混匀,离心5000g×10min,取上层水相到另一管中。

6、加1/10体积的3M醋酸钠(pH5.2)和2.5倍体积的无水乙醇,轻轻倒置混匀。

7、待絮状物出现后,离心5000g×5min,弃上清液。

8、沉淀用75%乙醇洗涤,离心5000g×3min,弃上清液。

9、室温下挥发乙醇,待沉淀将近透明后加50-100mlTE溶解过夜。

植物组织中DNA的提取

试验原理:

脱氧核糖核酸(deoxribonucleicacid,DNA)是一切生物细胞的重要组成成分,主要存在于细胞核中,盐溶法是提取DNA的常规技术之一。从细胞中分离得到的DNA是与蛋白质结合的DNA,其中还含有大量RNA,即核糖核蛋白。如何有效地将这两种核蛋白分开是技术的关键。DNA不溶于0.14mol/L的NaCl溶液中,而RNA则能溶于0.14mol/L的NaCl溶液之中,利用这一性质就可以将二者从破碎细胞浆液中分开。制备过程中,细胞破碎的同时就有Dnase释放到提取液中,使DNA因被降解而影响得率,在提取缓冲液中加入适量的柠檬酸盐和EDTA,既可抑制酶的活性又可使蛋白质变性而与核酸分离,再加入阴离子去垢剂0.15%的SDS,经过2h搅拌,或用氯仿-异醇除去蛋白,通过离心使蛋白质沉淀而除去,得到的是含有核酸的上清液。然后用95%的预冷乙醇即可把DNA从除去蛋白质的提取液中沉淀出来。

植物DNA的SDS提取法:

试验试剂:

1、研磨缓冲液:称取59.63gNaCl,13.25g柠檬酸三钠,37.2gEDTA-Na分别溶解后合并为一,用0.2mol/L的NaOH调至pH7.0,并定容至1000ml。

2、10×SSC溶液:称取87.66gNaCl和44.12g柠檬酸三钠,分别溶解,一起定容至1000ml。

3、1×SSC溶液:用10×SSC溶液稀释10倍。

4、0.1×SSC溶液:用1×SSC溶液稀释10倍。

5、Rnase溶液:用0.14mol/LNaCl溶液配制成25mg/ml的酶液,用1mol/LHCl,pH至5.0,使用前经80℃水浴处理5min(以破坏可能存在的Dnase)。

6、氯仿-异戊醇:按24ml氯仿和1ml异戊醇混合。

7、5mol/L高氯酸钠溶液:称取NaClO4.H2O70.23g,先加入少量蒸馏水溶解再容至100ml。

8、SDS(十二烷基硫酸钠)化学试剂的重结晶:将SDS放入无水酒精中达到饱和为止,然后在70~80℃的水浴中溶解,趁热过滤,冷却之后即将滤液放入冰箱,待结晶出现再置室温下凉干待用。

9、1mol/LHCl。

10、0.2mol/LNaOH。

11、二苯胺乙醛试剂:1.5g二苯胺溶于100ml冰醋酸中,添加1.5ml浓硫酸,装入棕色瓶,贮存暗处,使用时加0.1ml乙醛液〔浓乙醛:H2O=1:50(V/V)〕。

12、1.0mol/L高酸溶液(HClO4)。

13、0.05mol/LNaOH。

14、DNA标准液:取标准DNA25mg溶于少量0.05mol.L-1NaOH中,再用0.05mol/LNaOH定容至25ml,后用移溶管吸取此液5ml至50ml容量瓶中,加5.0ml1mol/LHClO4,混合冷却后用0.5mol/LHClO4定容至刻度,则得100μg/ml的标准溶液。

实验步骤:

1、称取植物幼嫩组织10g剪碎置研钵中,加10ml预冷研磨缓冲液并加入0.1g左右的SDS,置冰浴上研磨成糊状。

2、将匀浆无损转入25ml刻度试管中加入等体积的氯仿-异戊醇混合液,加上塞子,剧烈振荡30s,转入离心管,静置片刻以脱除组织蛋白质。以4000rpm离心5min。

3、离心形成三层,小心地吸取上层清液至刻度试管中,弃去中间层的细胞碎片、变性蛋白质及下层的氯仿。

4、将试管置72℃水浴中保温3min(不超过4min),以灭活组织的DNA酶,然后迅速取出试管置冰水浴中冷却到室温,加5mol/L高氯酸钠溶液〔提取液:高氯酸钠溶液=4:1(V/V)〕,使溶液中高氯酸钠的最终浓度为1mol/L。

5、再次加入等体积氯仿-异戊醇混合液至大试管中,振荡1min,静置后在室温下离心(4000rpm)5min,取上清液置小烧杯中。

6、用滴管吸95%的预冷乙醇,慢慢地加入烧杯中上清液的表面上,直至乙醇的体积为上清液的两倍,用玻璃棒轻轻搅动。此时核酸迅速以纤维状沉淀缠绕在玻璃棒上。

7、然后加入0.5ml左右的10×SSC,使最终浓度为1×SSC。

8、重复第6步骤和第7步骤即得到DNA的粗制品。

9、加入已处理的Rnase溶液,使其最后的作用浓度为50~70μg/ml,并在37℃水浴中保温30min,以除去RNA。

10、加入等体积的氯仿-异戊醇混合液,在三角瓶中振荡1min,再除去残留蛋白质及所加Rnase蛋白,室温下以4000rpm离心5min,收集上层水溶液。

11、再按6、7步骤处理即可得到纯化的DNA液。

植物DNA的CTAB提取法:

试验步骤:

1、称取新鲜叶片2-3g,剪碎放入研钵中,在液氮中研磨成粉末。

2、将粉末转移到加有7ml经预热的15×CTAB提取缓冲液15ml离心管中,迅速混匀后置于65℃水浴中,温育30min。

3、取出离心管,冷却至室温,加入氯仿/异戊醇(24:1),充分混匀,室温下2300转离心20min。

4、将上清转移至另一新的15ml离心管中,加入1/10体积10%的CTAB和等体积的氯仿/异戊醇。充分混匀,2300rpm离心20min。

5、转移上清至另一新的15ml离心管中,加入等体积1%的CTAB沉淀缓冲液,轻轻摇晃至形成DNA絮状沉淀。1000rpm离心10min,使DNA沉淀于管底。

6、加入1.5-2ml的1mol/LNaCl及5μlRNase置于56℃水浴中过夜。

7、待DNA完全溶解后,加2-3ml4℃预冷的95%的冰乙醇使DNA沉淀,挑出DNA,置于15ml离心管中,用70%乙醇清洗30min。

8、离心机甩5s,倒出70%乙醇,再用95%乙醇浸泡5min,倒出95%乙醇,在超净工作台上吹干。

9、将风干的DNA直接在4℃保存备用或溶于100μlTE溶液中于-20℃保存。

细菌DNA的提取方法

针对一些不易于提取的细菌的方法:

试验试剂:

抽提缓冲液:2%CTAB(W/V)2%PVPK25(w/v)(去色素)100mMTris-HCl(pH8.0)

25mMEDTA(pH8.0)2.0MNaCl

10MLiCl

2MLiCl

DEPC-water(抑制RNA酶活性)

3MNaAc(pH5.2)

96%乙醇

70%乙醇

试验步骤:

1、抽提缓冲液65℃预热。

2、加菌体到已经预热的缓冲液(700ul)中混匀,65℃,10min。

3、加酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),振荡,以12,000rpm,离心10min。

4、取上清,加氯仿/异戊醇(24:1)振荡,以12,000rpm,离心10min。

5、重复再作一次步骤4。

6、加入1/10体积的3M醋酸钠和1.5倍体积的乙醇(或加入等体积的异丙醇),-20C下沉淀。

7、以2,000rpm,离心10min。

8、弃上清,以70%乙醇条洗沉淀,也可以再用100%乙醇洗,然后溶解于100ml水中。

较为常用的细菌DNA提取方法:

实验步骤:

1、将菌株接种于液体LB培养基,37℃震荡培养过夜。

2、取1.5ml培养物12000rpm离心2min。

3、沉淀中加入567ul的TE缓冲液,反复吹打使之重新悬浮,加入30ul10%SDS和15ul的蛋白酶K,混匀,于37℃温育1h.

4、加入100ul5mol/LNaCl,充分混匀,再加入80ulCTAB/NaCl溶液,混匀后再65℃温育10min。

5、加入等体积的酚/氯仿/异戊醇混匀,离心4-5min,将上清转入一只新管中,加入0.6-0.8倍体积的异丙醇,轻轻混合直到DNA沉淀下来,沉淀可稍加离心。

6、沉淀用1ml的70%乙醇洗涤后,离心弃乙醇.

真菌DNA提取总结的两种方法:

第一种方法:

试验步骤:

1、取真菌菌丝0.5g,在液氮中迅速研磨成粉。

2、加入4mL提取液,快速振荡混匀。

3、加入等体积的4mL的氯仿:异戊醇(24:1),涡旋3~5min(此处是粗提没有加酚)。

4、以4℃,1000rpm,离心5min。

5、上清再用等体积的氯仿:异戊醇(24:1)抽提一次。以4℃,10,000rpm,离心5min。

6、取上清,加入2/3倍体积的-20℃预冷的异丙醇或2.5倍体积的无水乙醇沉淀,混匀,静置约30min。

7、用毛细玻棒挑出絮状沉淀,用75%乙醇反复漂洗数次,再用无水乙醇漂洗1次,吹干,重悬于500ulTE中。

8、加入1ulRNaseA(10mg/mL),37℃下处理1h。

9、用酚(pH8.0):氯仿:异戊醇(25:24:1)和氯仿:异戊醇(24:1)各抽提1次。以4℃,10,000rpm,离心5min。

10、取上清,加入1/10倍体积的3MNaAc,2.5倍体积的无水乙醇,-70℃沉淀30min以上。

11、沉淀用75%乙醇漂洗,风干,溶于200ulTE中,-20℃保存备用。

DNA提取液:0.2MTris-HCl(pH7.5),0.5MNaCl,0.01MEDTA,1%SDS,3MNaAc。

第二种方法:

试验步骤:

1、真菌菌丝0.5-1g,在液氮中迅速研磨成粉。

2、加入3mL65℃预热的DNA提取缓冲液,快速振荡混匀65℃水浴30min,期间混匀2-3次。

3、加入1mL5MKAc,冰浴20min。

4、等体积的氯仿:异戊醇(24:1)抽提1次(10,000rpm,4℃离心5min)。

5、取上清,加入2/3倍体积的-20℃预冷异丙醇,混匀,静置约30min。

6、用毛细玻棒挑出絮状沉淀,用75%乙醇反复漂洗数次,再用无水乙醇漂洗1次,吹干,重悬于500ulTE中。

7、加入1ulRNaseA(10mg/mL),37℃处理1h。

8、用酚(pH8.0):氯仿:异戊醇(25:24:1)和氯仿:异戊醇(24:1)各抽提1次。以4℃,10,000rpm,离心5min。

9、取上清,1/10V3MNaAc,2.5V体积的无水乙醇,-70℃沉淀30min以上。

10、沉淀用75%乙醇漂洗,风干,溶于200ulTE中,-20℃保存备用。
植物基因组提取(CATB法)
作者: 时间:2008-05-13 14:26:27 来源: 生物谷 浏览评论

一、实验目的
掌握植物总DNA的抽提方法和基本原理。学习根据不同的植物和实验要求设计和改良植物总DNA抽提方法。
二、实验原理
通常采用机械研磨的方法破碎植物的组织和细胞,由于植物细胞匀浆含有多种酶类(尤其是氧化酶类)对DNA的抽提产生不利的影响,在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强还原剂(如巯基乙醇)以降低这些酶类的活性。在液氮中研磨,材料易于破碎,并减少研磨过程中各种酶类的作用。
十二烷基肌酸钠(sarkosyl)、十六烷基三甲基溴化铵(hexadyltrimethyl ammomum bromide,简称为CTAB)、十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,简称SDS)等离子型表面活性剂,能溶解细胞膜和核膜蛋白,使核蛋白解聚,从而使DNA得以游离出来。再加入苯酚和氯仿等有机溶剂,能使蛋白质变性,并使抽提液分相,因核酸(DNA、RNA)水溶性很强,经离心后即可从抽提液中除去细胞碎片和大部分蛋白质。上清液中加入无水乙醇使DNA沉淀,沉淀DNA溶于TE溶液中,即得植物总DNA溶液。
三、实验材料
水稻幼叶
四、主要配方
2% CTAB抽提缓冲溶液: CTAB 4g NaCl 16.364 g 1M Tris-HCl 20ml( PH8.0) 0.5M EDTA 8ml,先用70ml ddH2O溶解, 再定容至200ml灭菌, 冷却后0.2-1% 2-巯基乙醇 (400ul) 氯仿-异戊醇(24:1):先加96ml氯仿,再加4ml异戊醇,摇匀即可。
五、实验步骤
1. DNA的提取
(1) 2%CTAB抽提缓冲液在65℃水浴中预热。
(2)取少量叶片(约1g)置于研钵中,用液氮磨至粉状;
(3) 加入700ul的2%CTAB抽提缓冲液,轻轻搅动;
(4) 将磨碎液分倒入1.5 ml的灭菌中,磨碎液的高度约占管的三分之二;
(5)置于65℃的水浴槽或恒温箱中,每隔10 min轻轻摇动,40 min后取出;
(6)冷却2 min后,加入氯仿-异戊醇(24:1)至满管,剧烈振荡2~3 min,使两者混合均匀;
(7)放入离心机中10 000 rpm离心10 min,与此同时,将600 µl的异丙醇加入另一新的灭菌中;
(8) 10 000 rpm离心1 min后,移液器轻轻地吸取上清夜,转入含有异丙醇的内,将离心管慢慢上下摇动30 sec,使异丙醇与水层充分混合至能见到DNA絮状物;
(9)10000 rpm离心1 min后,立即倒掉液体,注意勿将白色DNA沉淀倒出,将离心管倒立于铺开的纸巾上; (10)60 sec后,直立离心管,加入720 µl的75%乙醇及80 µl 5 M的醋酸钠,轻轻转动,用手指弹管尖,使沉淀与管底的DNA块状物浮游于液体中;
(11)放置30 min,使DNA块状物的不纯物溶解;
(12)10000 rpm离心1 min后,倒掉液体,再加入800 µl 75%的乙醇,将DNA再洗 30 min;
(13)10000 rpm离心30 sec后,立即倒掉液体,将离心管倒立于铺开的纸巾上;数分钟后,直立离心管,干燥DNA(自然风干或用风筒吹干);
(14)加入50 µl 0.5 × TE(含RNase)缓冲液,使DNA溶解,置于37℃恒温箱约15 h,使RNA消解;
(15)置于-20℃保存、备用。
2. DNA质量检测
琼脂糖电泳检测,原理和方法见实验二。
六、 注意事项
(1)叶片磨得越细越好。
(2)移液器的使用。
(3)由于植物细胞中含有大量的DNA酶,因此,除在抽提液中加入EDTA抑制酶的活性外,第一步的操作应迅速,以免组织解冻,导致细胞裂解,释放出DNA酶,使DNA降解。

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