swiss model建模同源性要多少比较好

40%
比较建模法是基于知识的蛋白质结构预测方法，又称为同源结构预测，是根据大量已知的蛋白质三维结构来预测序列已知而结构未知的蛋白质结构。
按照目前的定义，若待模型构建蛋白质的序列与模板序列经比对（ alignment ）后的序列同源性（ sequence identity ）在 40% （也有人认为在 35% ）以上，则它们的结构可能属于同一家族，它们是同源蛋白（ homology ），可以用同源蛋白模型构建的方法预测其三维结构。因为它们可能是由同一种蛋白质分化而来，它们具有相似的空间结构，相同或相近的功能。因此，若知道了同源蛋白家族中某些蛋白质的结构，就可以预测其它一些序列已知而结构未知的同源蛋白的结构，可以用同源模型构建的方法预测未知蛋白质的三维结构。 常用的数据库是swiss-model和interproscan。

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