ChIP-seq测序后该做哪些生物信息学分析 生物学父亲是什么意思
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高通量数据类型主要包括基因芯片和基因测序,我估计你想知道的是具体的内容。
具体的内容其实是指的高通量测序技术的应用,例如microarray,RNA-Seq,Exome-Seq,Target-Seq,Whole-genome-sequencing,宏基因组,16S RNA,microRNA,lncRNA测序等。
研究的问题就更五花八门了,像现在精准医疗的概念很火,主要是以基因测序为入口,后面的应用,例如产前诊断,孕前诊断等,甚至像亲子鉴定,肿瘤靶标等都可以通过生物信息学的分析手段来搞定。
生物信息分析分为几个层次,第一个层次基本上就是用别人做好的成熟软件,直接分析出你要的结果,再深入就是你会根据问题找到更合适的一些软件或者模块,自己组建一些分析流程,包括自己写一些辅助的程序脚本,更深入的层次就是市面上没有符合你要求的软件或者统计算法,你依据自己的需求,定制自己的分析过程,自己从头开始写基础程序,写统计算法,写模型等。到了这个程度就没有那么多限制了,主要比的是个人的思维想法以及眼界开阔程度。
现在也很多生物信息的分析方法应用在大数据的各个领域。本质是各种统计思维方法的实现,找出特定的模式结果。
首先进行质控过滤得到clean data;然后进行peaks calling,找出peaks;最后对这些peaks进行注释。
高级分析包括peaks的富集等等等等
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