对转基因食品持慎重（或怀疑）态度的理由有哪些 人们之所以对转基因食品持谨慎态度，是因为
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在人体健康方面，我们需要警惕转基因食品可能出现新的非预期蛋白，以及其所导致的非预期效应和潜在致敏性。
生物学家们相信，在四十多亿年的生物史中，跨种基因交流对生物进化的重要性，甚至超过了生物自身的基因重组和突变。
转基因技术是人类首次实现基因的跨种交流。虽然新一代的转基因技术已经可以进行精准的指定位点插入，但是这种快速而高效的外源基因导入技术，依然有可能会在受体体内合成研发者预期之外的蛋白质这些蛋白质很可能会造成非预期效应和潜在致敏性。
而在实质等同原则指导下，如果没有证据说明这些非预期蛋白质可能是致敏原和缺乏生物信息学的匹配，那么就没有理由进行血清IgE试验。
可是，虽然生物信息学家经常声称，序列一致性大于25%的蛋白质具有同源性和相似的功能，但是大部分具有如此低序列一致性的蛋白质，并不一定具有相同的特异性毒性性质或者完全一致的酶学功能。
这种情况下，出于谨慎的目的，FAO和WHO推荐使用针对性人血清或两组动物模型进行试验，来尝试确定一个与任何已知致敏原都不相似的蛋白可能存在的致敏或者交叉反应的风险。问题在于，针对性血清试验的预测能力从来没有被证明过，它有违于我们对交叉反应知识的直觉；而许多实验室也都尝试过不同动物模型测试预测蛋白质的过敏性，没有一个试验可以预测各种程度的有效致敏性。
这是当前人类生物学知识和技术条件下，生物安全性评估无法消除的潜在隐患。
但是转基因支持者也有不同的观点。他们认为，相比杂交和基因突变等“自然手段”，转基因技术对受体基因组的改变非常小。而且“自然手段”所导致的未知变化，只能通过表型变化来描述，相比之下，转基因生物却可以从插入位点、拷贝数、基因序列和编码产物几个方面来精确地描述其特性。从这个角度来说，转基因技术在非预期蛋白所导致的非预期效应和潜在致敏性方面，其风险反而较人类使用了数百年的杂交育种与诱变育种技术更为安全。
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在生态环境方面，科学家担心转基因农作物的推广会导致周边生态环境发生不可控的变化。
例如加速物种进化。自然界生物间的协同进化或生物与非生物抑制因子问的对抗可能出现适应或被淘汰的结果。通常选择压力越大，害虫抗性产生得越快。当抗虫基因在受体各营养器官中持续高浓度表达时，会大幅提高害虫的选择压力，导致害虫迅速进化出抗性基因。
转基因技术还有可能对非目标生物造成影响。抗虫基因不仅可以杀死目标生物，还会对部分拥有类似生理结构的非目标生物产生直接毒性作用，或通过食物链对非目标生物产生间接毒性作用。这样会对周边生态环境造成不可逆的影响，而其影响范围和程度，都是当前人类难以准确评估的。
此外，转基因技术有可能导致基因漂移。如果在转基因作物种植区域附近有同种或近缘种植物时，外源基因有可能通过异花授粉的形式导入其它植物，进而产生难以控制的杂草，对农作物产量造成巨大的负面影响。
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