chip+pcr实验图理解

  • chip-pcr模板浓度
    答:chip-pcr模板浓度范围为10ng/μL到100ng/μL。根据查询相关公开信息显示,chip-pcr是一种PCR技术,主要用于检测DNA损伤,浓度范围为10ng/μL到100ng/μL之间。ChIP-chip技术的发展为析活细胞或组织中DNA与蛋白质的相互关系提供了一个极为有力的工具,对芯片的构建进行改进,提高了其实用性。
  • 转录因子相关调控研究案例(二)
    答:最后作者通过CHIP实验验证磷酸化的HIF1结合到靶标基因启动子上促进基因的表达。Figure1说明的是LINK-A与蛋白BRK和LRRK2结合,并找到的与蛋白结合的RNA位点。A、RNA pull-down,用LncRNALink-A探针钓取细胞内与之结合的蛋白,联用质谱分析。B、RIP实验,用BRK和LRRK2蛋白抗体钓取与蛋白结合的RNA,...
  • MACS的原理
    答:泊松分布是统计与概率中重要的 离散分布 之一,泊松分布表示在一定的 时间 或 空间 内出现的事件个数,比如某一服务设施在一定时间内受到的服务请求的次数、DNA序列的变异数、汽车站台的等候人数。根据MACS的论文中所描述的,Chip-Seq实验中全基因组的reads分布恰好是符合泊松分布的。泊松分布的概率分布为...
  • 【转录因子】转录因子及其研究方法
    答:荧光探照灯:双荧光素酶实验: 这一探照灯照亮了转录因子与特定启动子序列的舞蹈,精准地揭示其调控的微妙触角。深度解析:染色质免疫共沉淀: ChIP技术如同显微镜下的微观世界,ChIP-PCR揭示转录因子与启动子的直接连接,而ChIP-seq则如放大镜般揭示了它们作用的整个元件图谱,揭示生态适应的深层逻辑。这些研究...
  • chip引物和普通引物一样吗
    答:不一样。Chip引物用于特定的实验或检测,如染色质免疫共沉淀(ChIP)实验,而普通引物用于更通用的PCR扩增或测序等实验,所以两者不一样。
  • 做染色体免疫共沉淀(CHIP)一般要多少钱啊?
    答:BUFFER不贵,贵的是抗体和珠子, 抗体按2UG一管算,珠子5ML 4000+ 每次用量70-80UL一管(免疫清洗+正式试验),珠子可以回收 抗体不行, 加上后面的DNA纯化,如果需要的话,再加上REAL-TIME PCR的钱,大概200-400之间吧,一个实验样品~
  • chip-pcr后还需要跑胶后是怎么计算含量的
    答:与普通的半定量pcr一样,根据条带亮度计算模板浓度。
  • ChIP要做内参么
    答:Input是断裂后的基因组DNA,需要与沉淀后的样品DNA一起经过逆转交联,DNA纯化,以及最后的PCR或其他方法检测。Input对照不仅可以验证染色质断裂的效果,还可以根据Input中的靶序列的含量以及染色质沉淀中的靶序列的含量,按照取样比例换算出ChIP的效率,所以Input对照是ChIP实验必不可少的步骤。
  • ChIP-seq和CUT&Tag技术
    答:和单细胞测序结合 : 由于PCR之前的反应都在细胞内进行,Henikoff博士通过分配单个细胞到5184纳米孔,再加入带随机标签的引物进行扩增的办法,实现单细胞测序。https://www.nature.com/articles/s41467-019-09982-5 https://www.sohu.com/a/331749726_120054289 附:CUT&Tag 实验操作流程 ConA磁珠...
  • 史上最全的30个生物实验技术及原理!
    答:1. GST pull-down: GST融合蛋白与谷胱甘肽树脂的巧妙结合,如同磁铁般吸引目标蛋白,用于揭示蛋白间的相互作用机制。2. 足印法: 这种DNA-蛋白质亲和力的指纹,揭示了两者结合的精确位置,犹如探寻生命密码的关键线索。3. ChIP实验: 体内蛋白质与DNA的亲密对话,通过细胞固定、断裂、免疫沉淀等步骤,揭示...

  • 网友评论:

    龙颖18632378086: 如何通过PCR证明ChIP富集有效 -
    15101令查 : 一般要通过两方面的实验验证:首先要选择几个MARKER基因进行扩增,看扩增质量如何;其次要扩增你的目的基因,看不同重复实验中的富集效果是否一致.要综合以上两点,通过PCR判断富集的DNA纯度,浓度是否符合实验要求.

    龙颖18632378086: 什么是染色质免疫共沉淀技术(ChIP)? -
    15101令查 : 染色质免疫沉淀(ChIP)实验指南及技术总结 ChIP是一项比较流行的研究转录因子(transcriptionfactor,TF)与启动子(promoter)相互结合的实验技术.由于ChIP采用甲醛固定活细胞或者组织的方法,所以能比较真实的反映细胞内TF与...

    龙颖18632378086: 染色体免疫共沉淀(CHIP)的实验步骤 -
    15101令查 : 染色体免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是基于体内分析发展起来的方法,也称结合位点分析法,在过去十年已经成为表观遗传信息研究的主要方法.这项技术帮助研究者判断在细胞核中基因组的某一特定位置会出现何种组蛋白修饰.ChIP不仅可以检测体内反式因子与DNA的动态作用,还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与基因表达的关系.近年来,这种技术得到不断的发展和完善.采用结合微阵列技术在染色体基因表达调控区域检查染色体活性,是深入分析癌症、心血管疾病以及中央神经系统紊乱等疾病的主要代谢通路的一种非常有效的工具.

    龙颖18632378086: 基因表达调控研究中主要实验技术有哪些 -
    15101令查 : 基因表达调控主要实验技术有:ChIP、RIP、RNA pull-down、EMSA、Luciferase 1、 ChIP实验 通过与染色质片段共沉淀和PCR技术,在体内检测与特异蛋白质结合的DNA片段.将处于适当生长时期的活细胞用甲醛交联后将细胞裂解, 染色...

    龙颖18632378086: 什么是ChIP实验,有什么应用,最好有图 -
    15101令查 : 染色质免疫共沉淀 看一个蛋白和染色体上的一段序列有没有相互作用

    龙颖18632378086: 染色质免疫沉淀(ChIP)中Input内参是做什么用的? -
    15101令查 : 在进行免疫沉淀前,需要取一部分断裂后的染色质做Input对照.Input是断裂后的基因组DNA,需要与沉淀后的样品DNA一起经过逆转交联,DNA纯化,以及最后的PCR或其他方法检测.Input对照不仅可以验证染色质断裂的效果,还可以根据Input中的靶序列的含量以及染色质沉淀中的靶序列的含量,按照取样比例换算出ChIP的效率,所以Input对照是ChIP实验必不可少的步骤.

    龙颖18632378086: chip - pcr后还需要跑胶后是怎么计算含量的 -
    15101令查 : 与普通的半定量pcr一样,根据条带亮度计算模板浓度.

    龙颖18632378086: 免疫沉淀反应各技术类型原理有什么异同和方法评?免疫沉淀反应各技术
    15101令查 : 免疫沉淀反应(Immunoprecipitation)主要用于抗原或者抗体的定性检测.其原理是指可溶性抗原与相应抗体在有电解质存在的情况下,按适当比例所形成的可见沉淀物现象.据此现象设计的沉淀实验主要包括絮状沉淀试验,环状沉淀试验和凝胶内的沉淀试验.凝胶内的沉淀试验依所用的实验方法又可分为免疫扩散实验和免疫电泳技术2类. 而westernblot虽然也是利用抗原-抗体反应的原理,但他是需要跑电泳的,抗原在电泳凝胶上分开成条带,之后把凝胶放当含有抗体的反应液(连续几步)中“显色”.

    龙颖18632378086: 染色质免疫沉淀(ChIP)原理是什么? -
    15101令查 : 基本原理:在生理状态下把细胞内的DNA与蛋白质交联在一起,通过超声或酶处理将染色质切为小片段后,利用抗原抗体的特异性识别反应,将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来. 染色质免疫沉淀技术一般包括细胞固定,染色质断裂,染色质免疫沉淀,交联反应的逆转,DNA的纯化,以及DNA的鉴定. 摘自柴晶晶博士的文章-染色质免疫沉淀(ChIP)技术的难点及应用

    龙颖18632378086: 如何通过chip确定与基因结合的蛋白质 -
    15101令查 : 染色质免疫沉淀,所以对ChIP实验过程的每一步都应设计相应的对照.当检测如转录调控因子一类的DNA结合蛋白,在生理状态下把细胞内的DNA与蛋白质交联在一起.如果你是只知道你的蛋白.染色质免疫沉淀技术一般包括细胞固定,可是双链或...

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