chip-seq可以送dna吗
答：Chip和Chip-seq是常用于研究基因组中染色质和蛋白质相互作用的实验技术。Chip实验用于检测染色质中特定蛋白质与DNA之间的相互作用。该技术通过使用特异性抗体与染色质中的目标蛋白质结合，并利用免疫沉淀、洗涤和DNA提取等步骤来分离和富集特定DNA序列。通过这种方式，可以获取与目标蛋白质结合的DNA序列。Chip...
答：1. ChIP-seqChIP-seq是结合染色质免疫沉淀和高通量测序的技术，用于检测特定DNA关联蛋白的位置。它通过抗体筛选目标蛋白与DNA的结合位点，涉及组蛋白修饰和转录因子调控。1.1 组蛋白修饰：组蛋白的N端尾部修饰（如甲基化、磷酸化、乙酰化等）影响染色质构型，从而影响基因表达。例如，H3K4me1与增强子区相...
答：CHIP-seq作为一种生物信息学工具，其基于DNA测序的数据为科研人员提供了深入探索生物领域的新途径。以下是其应用的主要领域：首先，通过CHIP-seq，研究人员能够精确地判断DNA链上特定位置的组蛋白修饰类型，这对于理解基因调控机制具有重要意义。其次，CHIP-seq技术能帮助检测RNA polymerase II以及其他转录因子...
答：详细解释：首先，我们需要了解Chip-Seq的核心技术构成。该技术的核心在于结合了基因芯片技术和高通量测序技术。基因芯片是一种微型化的生物传感器，能够捕获特定DNA或RNA序列的信息。而高通量测序技术则提供了大规模、高效率的测序能力。当这两者结合时，可以实现对基因表达水平的精确测量和大规模数据分析。其...
答：Chip-seq，即染色质免疫沉淀-测序（Chromatin Immunoprecipitation-sequencing）技术，是一种强大的生物研究手段，用于解析细胞内蛋白质与DNA之间的相互作用。它结合了ChIP技术，专注于转录因子结合位点和特定DNA修饰位点的研究，尤其是在基因组层面。其工作原理是首先通过ChIP技术富集目标蛋白结合的DNA片段，通过...
答：由于ChIP-Seq的数据是DNA测序的结果，为研究者提供了进一步深度挖掘生物信息的资源，研究者可以在以下几方面展开研究：（1）判断DNA链的某一特定位置会出现何种组蛋白修饰；（2）检测RNA polymerase II及其它反式因子在基因组上结合位点的精确定位；（3）研究组蛋白共价修饰与基因表达的关系；（4）CTCF转录...
答：研究直接结合DNA的蛋白或者调控这类蛋白的因子都可以。要弄清楚CHIP本质就是用抗体把它所识别的蛋白质（包括在CHIP过程中仍然能和这个蛋白结合的DNA和蛋白质等）给免疫沉淀下来，再分析这个免疫沉淀物里的DNA序列。所以只要能保证CHIP过程中你关注的蛋白和其他转录因子的结合不会被破坏，就可以来实现你的...
答：ChIP-seq 是一种研究蛋白质与DNA相互作用的技术，其流程涉及多个步骤:交联与提取: 使用甲醛增强细胞通透性，目标蛋白与DNA交联，随后裂解并提取核DNA。片段化与免疫沉淀: DNA通过超声或酶消化片段化，实验组与抗体结合形成复合物，对照组则直接解交联。沉淀后，通过蛋白酶和盐处理去除非特异性片段。测序与...
答：对于高级数据分析，我们有更深入的处理步骤。首先，我们将ChIP-Seq序列与参考序列进行比对，以确定序列的准确性和一致性。接着，进行Peak calling，即找出样品中显著的DNA区域（峰检测和计数），并计算平均峰长度和峰长的中位数。我们还关注样品Uniquely mapped reads在基因区域和基因间区的分布情况，以及对...
答：让这个绿色的圆圈代表一个允许转录的组蛋白。让这个红色的停止标记代表抑制转录的组蛋白。在细胞中，各种蛋白质都可以与DNA结合，这个芥末色的东西可能会促进这个基因的转录，这个粉红色的东西可能会抑制这个基因。我们可以使用ChIP-Seq找到!!! ChIP-seq代表“染色质免疫沉淀结合高通量测序”它能识别基因组...
网友评论：
宫卓15113594960：
CHIP - seq的基本介绍 -
56103穆致
： 染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究.将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段.ChIP-Seq的原理是:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序.研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息.
宫卓15113594960：
ChIP - seq能研究哪些蛋白,只有转录因子吗? -
56103穆致
： 研究直接结合DNA的蛋白或者调控这类蛋白的因子都可以.要弄清楚CHIP本质就是用抗体把它所识别的蛋白质(包括在CHIP过程中仍然能和这个蛋白结合的DNA和蛋白质等)给免疫沉淀下来,再分析这个免疫沉淀物里的DNA序列.所以只要能保证CHIP过程中你关注的蛋白和其他转录因子的结合不会被破坏,就可以来实现你的目的.
宫卓15113594960：
CHIP - seq的应用领域 -
56103穆致
： 由于ChIP-Seq的数据是DNA测序的结果,为研究者提供了进一步深度挖掘生物信息的资源,研究者可以在以下几方面展开研究:(1)判断DNA链的某一特定位置会出现何种组蛋白修饰;(2)检测RNA polymerase II及其它反式因子在基因组上结合位点的精确定位;(3)研究组蛋白共价修饰与基因表达的关系;(4)CTCF转录因子研究.
宫卓15113594960：
如何寻找靶基因结合的lincrna -
56103穆致
： 转录因子一半都结合在被调控基因的promoter区域,你可以做一个chip-seq实验,然后在基因组数据库中定位这些与该转录因子结合的DNA区域,那么这些区域的下游附近的基因就很可能是受该转录因子调控的基因.然后在针对这些疑似基因做转录因子KO之后的该基因mRNA水平检测(realtimePCR)确定是否受其调控.
宫卓15113594960：
什么是染色质免疫共沉淀技术(ChIP)? -
56103穆致
： 染色质免疫沉淀(ChIP)实验指南及技术总结 ChIP是一项比较流行的研究转录因子(transcriptionfactor,TF)与启动子(promoter)相互结合的实验技术.由于ChIP采用甲醛固定活细胞或者组织的方法,所以能比较真实的反映细胞内TF与...
宫卓15113594960：
怎么把染色体转化成基因名字 chip seq -
56103穆致
： 46:46条染色体;XY:指男性;del(15q11.1q13.1):指15号染色体q11.1到15号染色体q13.1位置片段缺失;seq[GRCh37/hg19](20,415,466-28,406,915)*1:指以GRCh37/hg19的人类参考序列为蓝本,15号染色体20,415,466-28,406,915位置为1拷贝(也就是缺失的意思),是del(15q11.1q13.1)的另一种表示方法.
宫卓15113594960：
chip - seq 的input需要扩增后测序吗 -
56103穆致
： 严格意义上不只是要做input,control也要做的(考虑到蛋白富集非靶向拉去的DNA片段) 当然很多时候,基本也做个input,input是一定要做的,要不然没办法做peak的calling.
宫卓15113594960：
MeDIP - Chip与MeDIP - seq 的区别? -
56103穆致
： chip是基于芯片设计的,而seq是基于测序设计的,故从分辨率讲,后者远远高于前者.另外seq是开放系统,是可以有效检测到未知的新的甲基化位点的,而chip则是封闭系统,只能检测到原有设计好探针的位点.
宫卓15113594960：
chip - exo sequencing和chip - seq的区别 -
56103穆致
： exo就是exonucleases,能够从5'至3'方向消化没有和蛋白结合的DNA.我的理解是,这样使得chip-exo捕获的片段更小,peak calling的精度更高,同时计算的motif也能更准确.
