ChIP-seq能研究哪些蛋白,只有转录因子吗?

研究直接结合DNA的蛋白或者调控这类蛋白的因子都可以。要弄清楚CHIP本质就是用抗体把它所识别的蛋白质(包括在CHIP过程中仍然能和这个蛋白结合的DNA和蛋白质等)给免疫沉淀下来,再分析这个免疫沉淀物里的DNA序列。所以只要能保证CHIP过程中你关注的蛋白和其他转录因子的结合不会被破坏,就可以来实现你的目的。

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