蛋白质组丰度数据整合数据库应用案例
中科院系统生物学重点实验室蛋白质组学研究平台与我们的服务紧密合作，利用其产生的蛋白质组学实验数据，对适配器技术进行了深入验证。实验结果显示，适配器技术成功地将不同实验室生成的多样化数据统一转换为PRIDESchema、MZML和iPRIDESchema等标准数据交换格式，极大地提升了数据的标准化和共享便利性，促进了实验室间的数据发布和交流。上海交通大学生命科学技术学院的某个实验室，具备基因芯片和蛋白质组数据的双重资源。他们选择通过我们的平台进行整合分析。首先，实验室将这些数据上传至我们的系统，接着利用平台内的PannBuilder等工具进行蛋白质注释和预处理。平台提供了丰富的功能，如组间比较、聚类和主成分分析，使得常规分析得以顺利进行。这样，我们就能够在平台上直观地对基因和蛋白质数据这两个生物学层次进行直接对比分析，深化了对生物系统的理解。
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