菌液加甲醛灭活后为什么用PCR扩不出目的带,灭活之前是可以扩出来的,模板是将菌液用煮沸法制备的 用菌斑跑PCR有目的条带,用菌液怎么就跑不出?

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甲醛可以固定蛋白质。灭活时,使得原来DNA上结合的蛋白固定无法脱离,肯定会影响引物的结合。有一种方法简称ChIP,就是用甲醛固定的办法研究DNA结合蛋白的,引物设计上需要相当的技巧。如果灭活是为了消毒,建议菌液煮沸即可。

可以试着不加甲醛,菌液直接煮沸,4度离心,取上清做实验。

还有可以直接使用菌液做PCR实验的,刚开始掌握不了的情况下,可以在你的体系中做一个菌液加入量的梯度。

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