杨应龙敢与明朝对抗除了倚仗了明朝形式，还有什么原因？
万历朝著名的战争有所谓的万历三大征和对努尔哈赤的战事。所谓万历三大征就是壬辰倭乱、宁夏之役和播州杨应龙之乱。杨应龙之所以能对抗朝廷，在于他世袭的播州宣慰司，播州所处的地理地形位置以及当时明朝平倭用兵无暇顾及的政治形势。
下面就说一下明朝平定播州杨应龙叛乱的过程：
杨应龙的家世及川贵两省的扯皮明朝沿袭元朝制度,在西南地区设置土司（土官），授予当地民族首领以宣慰使、宣抚使、安抚使、土知府、土知州、土知县等职实行间接统治。这些土司经常发动武装叛乱，朝廷的对策是,在平定叛乱后，实行“改土归流”——裁撤土司，改设流官。
例如，永乐十一年（1413年）思南等宣慰使叛乱平定后，改思南宣慰使司等为思南、思州、铜仁、石矸、黎平等府，并在此基础上设置了行省一级的贵州布政使司。
播州地处四川南端，与贵州相邻。播州宣慰使司就是由杨氏世袭的一个土司。杨氏的先世是山西太原人，唐朝乾符年间，始祖杨端征讨南诏，授武略将军，遂世守播州。
明初，杨鉴内附，改播州宣慰使司,求属四川，其地域广表千里，介于四川、湖广、贵州之间，西北堑山为关，东南俯江为地，领黄平、草塘二安抚使司，真、播、白泥、余庆、重安、容山六长官司，统七姓：田、张、袁、卢、谭、罗、吴。
隆庆五年（1571年）播州宣慰使杨烈死，其子杨应龙承袭其职。万历元年（1573年）神宗给杨应龙颁发宣慰使敕书一道，万历十四年（1586年）神宗又赐他都指挥使衔。
杨应龙生性雄猜，阴狠嗜杀，在播州专以酷杀树威，有小睚眦即戕杀，人人惴恐。他目睹四川官军弱不禁战每有征讨必调拨土司兵马，因而骄横跋扈，自恃富强，滋生虎踞全蜀的野心。甚至藐视朝廷法纪，在他的居所僭设龙凤，擅用阉宦，俨然一方土皇帝。
万历十七年（1589年）杨应龙所部何恩、宋世臣等及张氏叔、张时照向朝廷上加急文书告发杨应龙谋反。巡抚贵州都御史叶梦熊上疏请发兵征讨，而四川方面鉴于三面与播州交界，士大夫数度赴川贵军门，力陈剪除未为长策。因此四川巡抚、巡按都主“抚”，贵州抚按则主剿。
万历十八年（1590年）贵州巡抚叶梦熊上疏，向神宗指出，播州宣慰使杨应龙凶恶不道，东川道兵备使朱运昌有意纵恶。贵州巡按陈效也上疏弹劾杨应龙二十四大罪。当时朝廷正为“西虏”进犯松潘而忙于调兵遣将，松潘为全蜀门户，四川封疆大吏不敢怠慢，征调播州土司兵协守。
因此四川巡抚李化龙上疏神宗，请求暂免勘问杨应龙，给他一个戴罪立功的机会。由此开启了“此惩彼宥，黔蜀异议”的局面。
四川方面以为杨应龙无可勘之罪，贵州方面以为四川有私昵杨应龙之嫌。于是兵科都给事中张希皋等人向神宗建议,鉴于事情重大，两省利害相关，拟派遣有关科道官员从公会勘，或剩或抚,毋执成见。
神宗要兵部研究后提出一个方案。到了万历十九年（1591年）二月，神宗根据兵部的提议，命四川、贵州两省抚按官会勘杨应龙，朝廷不派官员参与此事。
叶梦熊
川贵抚按会勘的结果，意见截然相反。贵州巡抚叶梦熊主张把播州宣慰司及所辖五司全部改土归流，划归重庆管辖。四川巡抚李尚思、巡按李化龙不以为然，反对将播州改土归流，索性引嫌辞职。神宗不予批准，事情就搁置了下来。
四川方面确实是“私呢杨应龙”，不敢也不愿将播州改土归流。当杨应龙反叛迹象暴露时，叶梦熊请朝廷发兵征剿，蜀中士大夫顿时议论纷起，以为四川三面与播州相邻，播州兵骁勇善战，现在剪除不是上策。因为这个缘故，四川官员极力主张招抚，反对征剿。神宗下令两省会勘时，杨应龙也愿意赴蜀，不愿赴黔。
万历二十年（1592年）十二月，杨应龙被逮至重庆，对簿公堂，按法律当处斩。杨应龙愿以两万两银子赎罪。这时适逢壬辰倭乱，朝廷羽檄征天下兵，杨应龙便向神宗表示，愿亲自率兵五千“征倭”报效。神宗以东征为重，命四川抚按将杨应龙释放。当杨应龙正要率兵北上时，忽然传来神宗旨意：不必调杨应龙出征。新任四川巡抚黄员外（字于善，号泉皋，山东龙口人）一上任，立即下令严提杨应龙勘结。杨应龙盘踞播州，拒不服从。
朝廷的一味纵容与招抚
招抚不成,只有征剿。万历二十一年（1593年）正月，黄员外赶到重庆，与总兵刘成嗣、参将郭成等商议，分兵三路，同时并进。大军进至娄山关，驻兵白石口。杨应龙表面上派人求降，暗中埋伏重兵发动突然袭击，刘成嗣兵败，几乎全军覆没。黄员外因此而遭罢官，只得仓皇撤兵。
四川御史吴礼嘉上疏指责参将郭成等“失律”，神宗批示：“本酋朝廷原无意必诛，大兵一至，应自缚军门请死。今御史报与本酋奏辩，顺逆悬殊，行严查奏毋姑息。郭成等革任立功。移蜀新抚臣谭希思星驰赴任，与刘成嗣同贵州抚镇相机征剿。”
谭希思（字子诚，号岳南，湖广茶陵人）接任四川巡抚后，与贵州抚按计议相机征剿杨应龙，两省官员畏难而久议不决。
万历二十二年（1594年）三月，为了解决播州问题，神宗任命邢玠以兵部侍郎出任贵州总督。次年正月，邢玠赶到四川，计划先剪除杨应龙党羽，同时对他晓以大义，援引前不久宁夏叛乱的前车之鉴，向他指出前来投诚，当待以不死；否则国家悬赏万金购尔首级。
邢玠
四月间，重庆知府拿了总督邢玠的招抚信函抵达綦江县，就促杨应龙到安稳（地名）听勘，由綦江知县前往宣谕。杨应龙派其弟杨兆龙到安稳，准备了邮传储粮郊迎叩头，对来使（綦江知县）说：应龙待罪于松坎，之所以不敢到安稳，是因为安稳多仇民，欲伏兵伺杀，故请来使驾临松坎。
綦江知县请示知府后，于五月初八日单骑前往松坎。杨应龙果然捆绑于道旁，泣请死罪，膝行向前，叩头流血，表示愿意把罪人及罚金献于朝廷。邢玠得报，立即派官前往处理此事。杨应龙身穿囚服匍匐郊迎，缚献黄元等十二名罪人，抵杨应龙处斩，愿缴赎银四万两。
于是将杨应龙革职，由其长子杨朝栋暂代，将其次子杨可栋押往重庆作为人质。
当时壬辰倭乱还在进行，兵部意欲专注于东征，播州事务宜于暂缓。神宗也考虑到杨应龙一向积有功劳，便批准了邢玠的处理方案，在松坎设立同知，治理该地，并以重庆知府王士琦为川东兵备使弹压。
其实，杨应龙施的是缓兵之计，事情过后，不但毫无悔改，反而变本加厉。不久，借口次子死于重庆，扬言促取尸棺，拒不缴出赎银，甚至要挟说：“吾子活，银即至矣”，并且“分遣夷目，置关据险，僭立巡警，江内七牌，江外四牌，搜戮奏民、劫掠屯堡无虚日。厚抚诸苗，用以摧锋，名硬手。州人稍殷厚者因事诛之，没其家以养苗，诸苗人愿为出死力”。
朝廷下定决心派大军征剿
对杨应龙的招抚至此宣告失败。此后，杨应龙不断武装袭击川南、贵州湖广一带，朝廷忙于应付倭乱，一时无暇顾及。到了万历二十七年（1599年）二月，贵州巡抚江东之派都指挥使杨国柱率兵三千征剿杨应龙，遭到惨败，杨国柱战死。
杨应龙乘官军尚未赶到，先发制人，以八万兵力分头进犯南川、江津，攻陷綦江。重庆守臣惊恐，归还其子杨可栋尸棺，并厚加贿赂，以遏其攻势。神宗听说綦江陷落大为恼怒，下旨追夺前四川巡抚谭希思、贵州巡抚江东之官职，他下旨：“谭希思虽准听调，尚在地方，何得怠玩军情致贻大患。江东之贪功浪战损威辱国都着革了职为民当差，永不叙用。”赐李化龙尚方宝剑，可以便宜行事。
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