单细胞核测序+空间组学，烈冰助力重医附一院神经内科团队解析抑郁行为发生新机制
揭示抑郁行为的秘密：烈冰与重医附一院神经内科团队联手，用单细胞核测序与空间组学探索新机制
世界卫生组织的数据揭示，重度抑郁症（MDD）已成为全球首要的残疾原因，而男性研究已经初步探索了其细胞层面的奥秘（Corina Nagy, Nat Neurosci, 2020）。然而，对于女性受社会地位影响的抑郁样表型，这种探索尚未触及。重庆医科大学附属第一医院神经内科团队在2023年7月，借助于烈冰生物的科技力量，发布了Nature Neuroscience（IF=34.7002）的一项突破性研究，题为“Integrating spatial and single-nucleus transcriptomic data elucidates microglial-specific responses in female cynomolgus macaques with depressive-like behaviors”。
由终身教授谢鹏和郑鹏研究员共同指导，武靖博士后、李一帆博士、黄羽博士作为共同第一作者，烈冰生物深度参与了单细胞核测序（snRNA-Seq）和空间转录组（Spatial Transcriptome）技术的应用，以及关键数据的解析分析。
深入解析：实验设计与分析揭秘
研究团队精心设计，将高社会等级的对照组（Controls，n = 7）与低社会等级的抑郁样（Depressive Like，n = 7）和恢复（RES，n = 5）猴子分为三组，采用10x Genomics单细胞捕获平台，借助多种分析工具如细胞聚类分析、SubCluster、差异基因表达分析等，对数据进行精细解读。
关键发现：小胶质细胞在抑郁中的独特角色
通过对单细胞核测序数据的严谨质控，研究者识别出136,231个细胞核，并将其分为8个细胞大类。在对照组与抑郁组的对比中，发现240个不重复的差异表达基因，其中56.25%集中在小胶质细胞，提示这些细胞在抑郁行为中扮演重要角色。通过共表达网络分析和DisGeNET数据库的整合，研究团队确定了两个关键模式：抑郁相关的D-Pattern（小胶质细胞主导）和与社会地位相关的R-Pattern（星状胶质细胞主导）。
进一步的细分分析揭示，名为“抑郁样表型的促炎小胶质细胞”（PIMID）的亚群在抑郁样状态下表现出强烈的炎症特征，与IQGAP2、FYN等基因的表达相关，可能影响神经炎症反应。这一发现将为抑郁症的精准干预提供新的潜在靶点。
空间组学的洞察：定位和功能解析
借助空间组学，研究者揭示了抑郁行为相关基因在大脑区域的分布差异，特别是PIMID亚群，它主要位于猕猴大脑的第6层，对应于dlPFC ST区3。这一发现对于理解抑郁行为的神经生物学基础具有重要意义，为未来临床干预策略提供了新的视野。
总的来说，这次研究通过单细胞核测序与空间组学的结合，揭示了女性抑郁样行为背后的小胶质细胞机制，为抑郁症的防治提供了新的科学依据。这一里程碑式的成果将推动抑郁症研究的深入，为患者带来更精准的治疗可能。
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