chipseq数据分析流程 数据分析师的数据分析流程

ChIP-seq\u6d4b\u5e8f\u540e\u8be5\u505a\u54ea\u4e9b\u751f\u7269\u4fe1\u606f\u5b66\u5206\u6790

ChIP-seq\u6d4b\u5e8f\u540e\u8be5\u505a\u54ea\u4e9b\u751f\u7269\u4fe1\u606f\u5b66\u5206\u6790
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\u5177\u4f53\u7684\u5185\u5bb9\u5176\u5b9e\u662f\u6307\u7684\u9ad8\u901a\u91cf\u6d4b\u5e8f\u6280\u672f\u7684\u5e94\u7528\uff0c\u4f8b\u5982microarray\uff0cRNA-Seq\uff0cExome-Seq\uff0cTarget-Seq\uff0cWhole-genome-sequencing\uff0c\u5b8f\u57fa\u56e0\u7ec4\uff0c16S RNA\uff0cmicroRNA\uff0clncRNA\u6d4b\u5e8f\u7b49\u3002
\u7814\u7a76\u7684\u95ee\u9898\u5c31\u66f4\u4e94\u82b1\u516b\u95e8\u4e86\uff0c\u50cf\u73b0\u5728\u7cbe\u51c6\u533b\u7597\u7684\u6982\u5ff5\u5f88\u706b\uff0c\u4e3b\u8981\u662f\u4ee5\u57fa\u56e0\u6d4b\u5e8f\u4e3a\u5165\u53e3\uff0c\u540e\u9762\u7684\u5e94\u7528\uff0c\u4f8b\u5982\u4ea7\u524d\u8bca\u65ad\uff0c\u5b55\u524d\u8bca\u65ad\u7b49\uff0c\u751a\u81f3\u50cf\u4eb2\u5b50\u9274\u5b9a\uff0c\u80bf\u7624\u9776\u6807\u7b49\u90fd\u53ef\u4ee5\u901a\u8fc7\u751f\u7269\u4fe1\u606f\u5b66\u7684\u5206\u6790\u624b\u6bb5\u6765\u641e\u5b9a\u3002
\u751f\u7269\u4fe1\u606f\u5206\u6790\u5206\u4e3a\u51e0\u4e2a\u5c42\u6b21\uff0c\u7b2c\u4e00\u4e2a\u5c42\u6b21\u57fa\u672c\u4e0a\u5c31\u662f\u7528\u522b\u4eba\u505a\u597d\u7684\u6210\u719f\u8f6f\u4ef6\uff0c\u76f4\u63a5\u5206\u6790\u51fa\u4f60\u8981\u7684\u7ed3\u679c\uff0c\u518d\u6df1\u5165\u5c31\u662f\u4f60\u4f1a\u6839\u636e\u95ee\u9898\u627e\u5230\u66f4\u5408\u9002\u7684\u4e00\u4e9b\u8f6f\u4ef6\u6216\u8005\u6a21\u5757\uff0c\u81ea\u5df1\u7ec4\u5efa\u4e00\u4e9b\u5206\u6790\u6d41\u7a0b\uff0c\u5305\u62ec\u81ea\u5df1\u5199\u4e00\u4e9b\u8f85\u52a9\u7684\u7a0b\u5e8f\u811a\u672c\uff0c\u66f4\u6df1\u5165\u7684\u5c42\u6b21\u5c31\u662f\u5e02\u9762\u4e0a\u6ca1\u6709\u7b26\u5408\u4f60\u8981\u6c42\u7684\u8f6f\u4ef6\u6216\u8005\u7edf\u8ba1\u7b97\u6cd5\uff0c\u4f60\u4f9d\u636e\u81ea\u5df1\u7684\u9700\u6c42\uff0c\u5b9a\u5236\u81ea\u5df1\u7684\u5206\u6790\u8fc7\u7a0b\uff0c\u81ea\u5df1\u4ece\u5934\u5f00\u59cb\u5199\u57fa\u7840\u7a0b\u5e8f\uff0c\u5199\u7edf\u8ba1\u7b97\u6cd5\uff0c\u5199\u6a21\u578b\u7b49\u3002\u5230\u4e86\u8fd9\u4e2a\u7a0b\u5ea6\u5c31\u6ca1\u6709\u90a3\u4e48\u591a\u9650\u5236\u4e86\uff0c\u4e3b\u8981\u6bd4\u7684\u662f\u4e2a\u4eba\u7684\u601d\u7ef4\u60f3\u6cd5\u4ee5\u53ca\u773c\u754c\u5f00\u9614\u7a0b\u5ea6\u3002
\u73b0\u5728\u4e5f\u5f88\u591a\u751f\u7269\u4fe1\u606f\u7684\u5206\u6790\u65b9\u6cd5\u5e94\u7528\u5728\u5927\u6570\u636e\u7684\u5404\u4e2a\u9886\u57df\u3002\u672c\u8d28\u662f\u5404\u79cd\u7edf\u8ba1\u601d\u7ef4\u65b9\u6cd5\u7684\u5b9e\u73b0\uff0c\u627e\u51fa\u7279\u5b9a\u7684\u6a21\u5f0f\u7ed3\u679c\u3002

1. \u8bc6\u522b\u4fe1\u606f\u9700\u6c42
\u8bc6\u522b\u4fe1\u606f\u9700\u6c42\u662f\u786e\u4fdd\u6570\u636e\u5206\u6790\u8fc7\u7a0b\u6709\u6548\u6027\u7684\u9996\u8981\u6761\u4ef6\uff0c\u53ef\u4ee5\u4e3a\u6536\u96c6\u6570\u636e\u3001\u5206\u6790\u6570\u636e\u63d0\u4f9b\u6e05\u6670\u7684\u76ee\u6807\u3002
2.\u6570\u636e\u91c7\u96c6
\u4e86\u89e3\u6570\u636e\u91c7\u96c6\u7684\u610f\u4e49\u5728\u4e8e\u771f\u6b63\u4e86\u89e3\u6570\u636e\u7684\u539f\u59cb\u9762\u8c8c\uff0c\u5305\u62ec\u6570\u636e\u4ea7\u751f\u7684\u65f6\u95f4\u3001\u6761\u4ef6\u3001\u683c\u5f0f\u3001\u5185\u5bb9\u3001\u957f\u5ea6\u3001\u9650\u5236\u6761\u4ef6\u7b49\u3002\u5e2e\u52a9\u6570\u636e\u5206\u6790\u5e08\u66f4\u6709\u9488\u5bf9\u6027\u7684\u63a7\u5236\u6570\u636e\u751f\u4ea7\u548c\u91c7\u96c6\u8fc7\u7a0b\uff0c\u907f\u514d\u7531\u4e8e\u8fdd\u53cd\u6570\u636e\u91c7\u96c6\u89c4\u5219\u5bfc\u81f4\u7684\u6570\u636e\u95ee\u9898;\u540c\u65f6\u5bf9\u6570\u636e\u91c7\u96c6\u903b\u8f91\u7684\u8ba4\u8bc6\u589e\u52a0\u4e86\u6570\u636e\u5206\u6790\u5e08\u5bf9\u6570\u636e\u7684\u7406\u89e3\u7a0b\u5ea6\uff0c\u5c24\u5176\u662f\u6570\u636e\u4e2d\u7684\u5f02\u5e38\u53d8\u5316\u3002
2.\u6570\u636e\u5b58\u50a8
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3.\u6570\u636e\u63d0\u53d6
\u6570\u636e\u63d0\u53d6\u662f\u5c06\u6570\u636e\u53d6\u51fa\u7684\u8fc7\u7a0b\uff0c\u6570\u636e\u63d0\u53d6\u7684\u6838\u5fc3\u73af\u8282\u662f\u4ece\u54ea\u53d6\u3001\u4f55\u65f6\u53d6\u3001\u5982\u4f55\u53d6\u3002\u5728\u6570\u636e\u63d0\u53d6\u9636\u6bb5\uff0c\u6570\u636e\u5206\u6790\u5e08\u9996\u5148\u9700\u8981\u5177\u5907\u6570\u636e\u63d0\u53d6\u80fd\u529b\u3002\u5e38\u7528\u7684Select From\u8bed\u53e5\u662fSQL\u67e5\u8be2\u548c\u63d0\u53d6\u7684\u5fc5\u5907\u6280\u80fd\uff0c\u4f46\u5373\u4f7f\u662f\u7b80\u5355\u7684\u53d6\u6570\u5de5\u4f5c\u4e5f\u6709\u4e0d\u540c\u5c42\u6b21\u3002
4.\u6570\u636e\u6316\u6398
\u6570\u636e\u6316\u6398\u662f\u9762\u5bf9\u6d77\u91cf\u6570\u636e\u65f6\u8fdb\u884c\u6570\u636e\u4ef7\u503c\u63d0\u70bc\u7684\u5173\u952e\uff0c\u4ee5\u4e0b\u662f\u7b97\u6cd5\u9009\u62e9\u7684\u57fa\u672c\u539f\u5219\uff1a\u6ca1\u6709\u6700\u597d\u7684\u7b97\u6cd5\uff0c\u53ea\u6709\u6700\u9002\u5408\u7684\u7b97\u6cd5\uff0c\u7b97\u6cd5\u9009\u62e9\u7684\u539f\u5219\u662f\u517c\u5177\u51c6\u786e\u6027\u3001\u53ef\u64cd\u4f5c\u6027\u3001\u53ef\u7406\u89e3\u6027\u3001\u53ef\u5e94\u7528\u6027\u3002\u6ca1\u6709\u4e00\u79cd\u7b97\u6cd5\u80fd\u89e3\u51b3\u6240\u6709\u95ee\u9898\uff0c\u4f46\u7cbe\u901a\u4e00\u95e8\u7b97\u6cd5\u53ef\u4ee5\u89e3\u51b3\u5f88\u591a\u95ee\u9898\u3002
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5.\u6570\u636e\u5206\u6790
\u5206\u6790\u6570\u636e\u662f\u5c06\u6536\u96c6\u7684\u6570\u636e\u901a\u8fc7\u52a0\u5de5\u3001\u6574\u7406\u548c\u5206\u6790\u3001\u4f7f\u5176\u8f6c\u5316\u4e3a\u4fe1\u606f\uff0c\u901a\u5e38\u6240\u7528\u7684\u65b9\u6cd5\u6709\uff1a\u8001\u4e03\u79cd\u5de5\u5177\uff0c\u5373\u6392\u5217\u56fe\u3001\u56e0\u679c\u56fe\u3001\u5206\u5c42\u6cd5\u3001\u8c03\u67e5\u8868\u3001\u6563\u6b65\u56fe\u3001\u76f4\u65b9\u56fe\u3001\u63a7\u5236\u56fe;\u65b0\u4e03\u79cd\u5de5\u5177\uff0c\u5373\u5173\u8054\u56fe\u3001\u7cfb\u7edf\u56fe\u3001\u77e9\u9635\u56fe\u3001KJ\u6cd5\u3001\u8ba1\u5212\u8bc4\u5ba1\u6280\u672f\u3001PDPC\u6cd5\u3001\u77e9\u9635\u6570\u636e\u56fe\u3002
6.\u6570\u636e\u53ef\u89c6\u5316
\u6570\u636e\u5206\u6790\u754c\u6709\u4e00\u53e5\u7ecf\u5178\u540d\u8a00\uff0c\u5b57\u4e0d\u5982\u8868\uff0c\u8868\u4e0d\u5982\u56fe\u3002\u522b\u8bf4\u5e73\u5e38\u4eba\uff0c\u6570\u636e\u5206\u6790\u5e08\u81ea\u5df1\u770b\u6570\u636e\u4e5f\u5934\u5927\u3002\u8fd9\u65f6\u5c31\u5f97\u9760\u6570\u636e\u53ef\u89c6\u5316\u7684\u795e\u5947\u9b54\u529b\u4e86\u3002\u9664\u6389\u6570\u636e\u6316\u6398\u8fd9\u7c7b\u9ad8\u7ea7\u5206\u6790\uff0c\u4e0d\u5c11\u6570\u636e\u5206\u6790\u5e08\u7684\u5e73\u5e38\u5de5\u4f5c\u4e4b\u4e00\u5c31\u662f\u76d1\u63a7\u6570\u636e\u89c2\u5bdf\u6570\u636e\u3002
7.\u6570\u636e\u5e94\u7528
\u6570\u636e\u5e94\u7528\u662f\u6570\u636e\u5177\u6709\u843d\u5730\u4ef7\u503c\u7684\u76f4\u63a5\u4f53\u73b0\uff0c\u8fd9\u4e2a\u8fc7\u7a0b\u9700\u8981\u6570\u636e\u5206\u6790\u5e08\u5177\u5907\u6570\u636e\u6c9f\u901a\u80fd\u529b\u3001\u4e1a\u52a1\u63a8\u52a8\u80fd\u529b\u548c\u9879\u76ee\u5de5\u4f5c\u80fd\u529b\u3002
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数据分析流程,首先你要把这个流程给分析好,然后再进行简单的策划,描写描绘等一系列方式才进行比较对比就行了

数据分析过程当中,首先需要确定分析定位。
然后就可以令分析设备的后台编程程序进行具体的分析操作过程。

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