重医大附一院的科教成效显著。
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设有临床医学博士后流动站，临床医学一级学科博士学位授权点（下含二、三级学科博士学位授权点29个），硕士学位授权点31个，国家级重点学科2个 (传染病学、神经病学)，省(市)级重点学科（二级学科）17个，重庆市医学重点学科8个。有重庆市神经病学重点实验室1个、重庆市医学重点实验室3个，研究室13个，教研室22个，教学基地医院13个。有传染病与寄生虫病学、神经病学、心脑血管疾病防治研究所各1所。重庆医科大学卫生学校和重庆医科大学附属第一医院卫生学校各1所。医院作为重庆医科大学最大的临床教学基地，每年承担了3000余名不同学制医学生的教学任务，能培养博士后、博士、硕士、7年制、本科、专科等各种层次的医学人才。
医院始终坚持“科教兴院”、“人才强院”的发展战略，获得了包括国家高技术研究发展计划(863计划)、国家自然科学基金重点项目、国家科技攻关项目等在内的国家各级科研课题400余项，获得国家科技进步二等奖在内的各级科技成果奖近60项，在科技统计源期刊上发表的科技论文数居全国医疗机构第22名。
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