用R画ROC曲线的pROC包中roc的参数response和predictor分别具体指什么呢？ 如何用R语言画ROC曲线图
\u5728SPSS\u4e2d\u7ed8\u5236ROC\u66f2\u7ebf\u65f6\u7684"\u68c0\u9a8c\u53d8\u91cf"\u4e0e"\u72b6\u6001\u53d8\u91cf"\u5206\u522b\u6307\u4ec0\u4e48\u68c0\u9a8c\u53d8\u91cf\u76f8\u5f53\u4e8e\u81ea\u53d8\u91cf\uff0c\u72b6\u6001\u53d8\u91cf\u76f8\u5f53\u4e8e\u56e0\u53d8\u91cf
\u7528auc\u547d\u4ee4\u548cplot\u547d\u4ee4\u6765\u7ed8\u5236
roc函数画图一般只用写两个参数，我一般是这样记的：roc(label,score)
label指的是你预测出来的分类变量的类别
score是你用模型预测的变量的得分值
绛旓細roc鍑芥暟鐢诲浘涓鑸彧鐢ㄥ啓涓や釜鍙傛暟锛屾垜涓鑸槸杩欐牱璁扮殑锛歳oc(label,score)label鎸囩殑鏄綘棰勬祴鍑烘潵鐨勫垎绫诲彉閲忕殑绫诲埆 score鏄綘鐢ㄦā鍨嬮娴嬬殑鍙橀噺鐨勫緱鍒嗗
绛旓細杩欏皢鍒涘缓涓涓悕涓哄寘鍚 ROC 鏇茬嚎鏁版嵁鐨勫璞°傜劧鍚庯紝鎮ㄥ彲浠ヤ娇鐢ㄨ鍑芥暟缁樺埗 ROC 鏇茬嚎锛屽涓嬫墍绀猴細roc_curveplot 鎴栬咃紝鎮ㄥ彲浠浣跨敤 pROC 鍖呬腑鐨勫嚱鏁颁负 ROC 鏇茬嚎鍒涘缓 ggplot 瀵硅薄锛屽鏋滈渶瑕侊紝鍙互杩涗竴姝ヨ嚜瀹氫箟璇ュ璞°備笅闈㈡槸濡備綍浣跨敤璇ュ嚱鏁扮殑绀轰緥锛歡grocggroc 杩欏皢鍒涘缓涓涓悕涓 ggplot 鐨勫璞★紝鐒跺悗鎮ㄥ彲浠...
绛旓細ROC鏇茬嚎灏辨槸鐢ㄦ潵鍒ゆ柇璇婃柇鐨勬纭,鏈鐞嗘兂鐨勫氨鏄洸绾夸笅鐨勯潰绉负1,姣旇緝鐞嗘兂鐨勭姸鎬佸氨鏄洸绾夸笅鐨勯潰绉湪0.8-0.9涔嬮棿,0.5鐨勮瘽瀵瑰疄楠岀粨鏋滄病鏈変粈涔堝奖鍝嶃 鎻愬埌ROC鏇茬嚎,灏辩涓嶅紑AUC(ROC鏇茬嚎涓嬮潰绉),鍏跺垽瀹氭柟娉曚负AUC搴旇澶т簬0.5銆俁OC鏇茬嚎鏄牴鎹笌瀵硅绾胯繘琛屾瘮杈冩潵鍒ゆ柇妯″瀷鐨勫ソ鍧,浣嗚繖鍙槸涓绉嶇洿瑙変笂鐨勫畾鎬у垎鏋,濡傛灉鎴戜滑闇瑕...
绛旓細ROCR鍖呬腑涓昏鏄袱涓猚lass:prediction鍜宲erformance銆傚墠鑰呮槸灏嗛娴嬬粨鏋滃拰鐪熷疄鏍囩缁勫悎鍦ㄤ竴璧凤紝鐢熸垚涓涓 prediction瀵硅薄锛岀劧鍚庡湪鐢╬erformance鍑芥暟锛屾寜鐓х粰瀹氱殑璇勪环鏂规硶锛岀敓鎴愪竴涓猵erformance瀵硅薄锛屾渶鍚庣洿鎺ュ performance鐢╬lot鍑芥暟灏辫兘缁樺埗鍑虹浉搴鐨凴OC鏇茬嚎銆
绛旓細ROCR鍖呬腑涓昏鏄袱涓猚lass锛歱rediction鍜宲erformance銆傚墠鑰呮槸灏嗛娴嬬粨鏋滃拰鐪熷疄鏍囩缁勫悎鍦ㄤ竴璧凤紝鐢熸垚涓涓 prediction瀵硅薄锛岀劧鍚庡湪鐢╬erformance鍑芥暟锛屾寜鐓х粰瀹氱殑璇勪环鏂规硶锛岀敓鎴愪竴涓猵erformance瀵硅薄锛屾渶鍚庣洿鎺ュ performance鐢╬lot鍑芥暟灏辫兘缁樺埗鍑虹浉搴鐨凴OC鏇茬嚎銆 123456 # plot a ROC curve for a single prediction...
绛旓細plot(rpart.ROC,add = TRUE,col = "blue")涓夌鍒嗙被鍣ㄧ殑ROC鏇茬嚎 璇存槑灏嗕笉鍚岀殑鍒嗙被妯″瀷鐨凴OC鏇茬嚎缁樺埗鍦ㄥ悓涓涓浘涓繘琛屾瘮杈冿紝璁剧疆璁粌杩囩▼鐨勬帶鍒跺弬鏁颁负閲嶅涓夋鐨10鎶樹氦鍙夐獙璇侊紝妯″瀷鎬ц兘鐨勮瘎浼板弬鏁颁负twoClassSummary,鐒跺悗鍦ㄤ娇鐢╣lm,svm,rpart,涓夌涓嶅悓鐨勬柟娉曞缓绔嬪垎绫绘ā鍨嬨備粠鍥句腑鍙互鐪嬪嚭锛宻vm瀵硅缁冮泦...
绛旓細鍋氬鎸囨爣roc鏇茬嚎锛岄鍏堣蒋浠跺噯澶囷紝R锛氬埄鐢╮norm鍑芥暟浜х敓闅忔満鏁帮紝浣滀负graphpad缁樺浘鐨勮緭鍏ユ枃浠躲侴raphpadprism5锛缁樺埗ROC鏇茬嚎銆傞拡瀵规墍鐢熸垚鐨勯娴嬫鐜囪繘琛孯OC鏇茬嚎缁樺埗锛屽皢棰勬祴姒傜巼鏀惧叆妫楠屽彉閲忥紝浜庢槸锛屽緱鍒颁笁涓寚鏍囩患鍚堢殑ROC鏇茬嚎銆備粈涔堟槸roc涔板叆淇″彿锛熷綋roc鎸囨爣浠庝笂寰涓嬭穼鐮0鏃讹紝鏄崠鍑轰俊鍙凤紝褰搑oc鎸囨爣浠庝笅寰涓婄獊鐮0...
绛旓細鎺ュ彈鑰呮搷浣滅壒鎬ф洸绾挎槸鎸囧湪鐗瑰畾鍒烘縺鏉′欢涓嬶紝浠ヨ璇曞湪涓嶅悓鍒ゆ柇鏍囧噯涓嬫墍寰楃殑铏氭姤姒傜巼P锛坹/N锛変负妯潗鏍囷紝浠ュ嚮涓鐜嘝锛坹/SN锛変负绾靛潗鏍囷紝鐢诲緱鐨勫悇鐐圭殑杩炵嚎锛岃繖灏辨槸roc澶氭寚鏍囨洸绾跨粯鐢汇ROC鏇茬嚎鐨鐗规 锛1锛壩插肩殑鏀瑰彉鐙珛浜巇鈥欑殑鍙樺寲锛岃冨療尾鍊煎彉鍖栧P锛坹/SN锛夊拰P锛坹/N锛夌殑褰卞搷鏃跺彂鐜帮細褰撐叉帴杩0...
绛旓細2. PR鏇茬嚎鐨绉樺瘑PR鏇茬嚎锛屽嵆鏌ュ噯鐜囷紙Precision, P锛変笌鍙洖鐜囷紙Recall, R锛夌殑妗ユ锛屽埢鐢讳簡棰勬祴鎬ц兘銆傛煡鍑嗙巼琛￠噺棰勬祴涓烘绫荤殑鏍锋湰涓疄闄呬负姝ｇ殑姣斾緥锛岃屽彫鍥炵巼鍒欒 閲忓疄闄呮绫讳腑琚纭瘑鍒殑姣斾緥銆缁樺埗姝ラ锛氶鍏堬紝鏍规嵁棰勬祴姒傜巼鍊煎鏍锋湰鎺掑簭锛岀劧鍚庨愭璋冩暣闃堝硷紝璁板綍姣忎釜闃堝间笅鐨凱鍜孯锛屾渶鍚庣粯鍒禤R鏇茬嚎锛屾í绾...
绛旓細鏈哄櫒瀛︿範妯″瀷璇勪环鎸囨爣鍙奟瀹炵幇 1.ROC鏇茬嚎 鑰冭檻涓涓簩鍒嗛棶棰橈紝鍗冲皢瀹炰緥鍒嗘垚姝ｇ被锛坧ositive锛夋垨璐熺被锛坣egative锛夈傚涓涓簩鍒嗛棶棰樻潵璇达紝浼氬嚭鐜板洓绉嶆儏鍐点傚鏋滀竴涓疄渚嬫槸姝ｇ被骞朵笖涔熻 棰勬祴鎴愭绫伙紝鍗充负鐪熸绫伙紙True positive锛,濡傛灉瀹炰緥鏄礋绫昏棰勬祴鎴愭绫伙紝绉颁箣涓哄亣姝ｇ被锛團alse positive锛夈傜浉搴斿湴锛...
