chip-seq实验原理
答：ChIP-Seq的原理是：首先通过染色质免疫共沉淀技术（ChIP）特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，并对其进行纯化与文库构建；然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上，从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息。
答：Chip-seq，即染色质免疫沉淀-测序（Chromatin Immunoprecipitation-sequencing）技术，是一种强大的生物研究手段，用于解析细胞内蛋白质与DNA之间的相互作用。它结合了ChIP技术，专注于转录因子结合位点和特定DNA修饰位点的研究，尤其是在基因组层面。其工作原理是首先通过ChIP技术富集目标蛋白结合的DNA片段，通过纯...
答：1. ChIP-seqChIP-seq是结合染色质免疫沉淀和高通量测序的技术，用于检测特定DNA关联蛋白的位置。它通过抗体筛选目标蛋白与DNA的结合位点，涉及组蛋白修饰和转录因子调控。1.1 组蛋白修饰：组蛋白的N端尾部修饰（如甲基化、磷酸化、乙酰化等）影响染色质构型，从而影响基因表达。例如，H3K4me1与增强子区相...
答：这里需要知道，ChIPseq是利用抗体去结合特异的靶蛋白，进而去沉淀靶蛋白结合的DNA。理论上，只要抗体设计的好，与蛋白质结合的 DNA 的都可以检测到。我们一般用 ChIPseq 检测转录因子的结合，以及检测组蛋白修饰，二者有着截然不同的峰形：转录因子结合的特征峰，峰型高，而且窄：组蛋白修饰结合的特征峰...
答：在全基因组水平，检测某个DNA结合蛋白的分布。是ChIP-seq的一种替代方案，在体外重组表达转录因子蛋白，与基因组DNA相互作用，对与重组蛋白结合的DNA测序，分析获得蛋白结合的基因位置，以及特异的DNA基序（motif）。由于不需要特异抗体、以DNA与蛋白质的固定，比起ChIP-seq降低了实验的技术要求。由于是体外...
答：对于高级数据分析，我们有更深入的处理步骤。首先，我们将ChIP-Seq序列与参考序列进行比对，以确定序列的准确性和一致性。接着，进行Peak calling，即找出样品中显著的DNA区域（峰检测和计数），并计算平均峰长度和峰长的中位数。我们还关注样品Uniquely mapped reads在基因区域和基因间区的分布情况，以及对...
答：Chip-Seq：一种转录组学研究技术 答案解析：Chip-Seq技术定义：是一种高通量的生物学研究方法，用于研究基因组中特定区域的转录情况。它通过结合基因芯片和大规模测序技术，实现对基因表达水平的大规模并行分析。这种技术特别适用于研究基因表达调控、转录因子结合位点以及基因变异对表达的影响等领域。详细解释...
答：ChIL-seq 避免了传统ChIP-seq技术中由于抗体沉淀所带来的回收率低的缺陷，尤其适用于贴壁细胞。对于活跃的组蛋白标记如H3K4me3 ，H3K27ac，起始细胞用量甚至可降低至单细胞水平。[2]原理：在96孔板中加入细胞，经固定，染色后加入一抗与目标蛋白结合，随后加入ChIL探针（由二抗和ChIL DNA组成），探针中的...
答：对于探究DNA结合蛋白，ChIP-seq的实验就是为了富集与特异蛋白结合的DNA。首先通过原位甲醛交联DNA和蛋白，接着超声打断DNA成200-600bp的小片段，用抗体免疫沉淀感兴趣的DNA-蛋白复合物。最后解交联，对释放的DNA进行测序。对于探究核小体位置或者组蛋白修饰，常常用到微球菌核酸酶（MNase)消化直接使染色质...
答：1、 CHIP-qPCR 研究 VCaP细胞在有或无E2处理时 ERα 聚集到 NEAT1 启动子区。IgG或ERα抗体沉淀下复合物后，针对猜测的DNA序列设计引物检测是否有特定的DNA序列与Erα结合。适用于想要研究某个特定蛋白是否结合自己猜测的基因。需要针对基因不同区段设计引物。2、 CHIP-seq 研究 SW480细胞内转录因子...
网友评论：
翁饶17291326809：
CHIP - seq的基本介绍 -
22814延质
： 染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究.将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段.ChIP-Seq的原理是:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序.研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息.
翁饶17291326809：
什么是染色质免疫共沉淀技术(ChIP)? -
22814延质
： 染色质免疫沉淀(ChIP)实验指南及技术总结 ChIP是一项比较流行的研究转录因子(transcriptionfactor,TF)与启动子(promoter)相互结合的实验技术.由于ChIP采用甲醛固定活细胞或者组织的方法,所以能比较真实的反映细胞内TF与...
翁饶17291326809：
酶的特异性鉴定试验 -
22814延质
： 实验目的】1.了解酶的特异性2.掌握检查酶特异性的方法及原理 【实验原理】酶是生物体内一类具有催化功能的蛋白质(传统酶的概念),即生物催化剂.它与一般催化剂的最主要区别就是具有高度的特异性(专一性).所谓特异性是指酶...
翁饶17291326809：
质粒DNA琼脂糖凝胶电泳图该怎么分析 -
22814延质
： 一、实验名称:质粒DNA的提取与纯化,DNA琼脂糖凝胶电泳 二、实验原理: 1.质粒DNA的提取: 质粒是一类存在于几乎所有细菌等微生物中染色体之外(细胞质中)呈游离状态的双链、闭环的DNA分子,能够自主复制和稳定遗传,以超螺旋...
翁饶17291326809：
请问ChIP - PET的作用与原理是什么,有哪位高手能指点一下,谢谢 -
22814延质
： pet是一种sequence方法,其原理相当于chip-seq 以全基因组分析表明蛋白质在哺乳动物细胞中的DNA相互作用的全貌.更详细的也可以分享给你
翁饶17291326809：
CHIP - seq的应用领域 -
22814延质
： 由于ChIP-Seq的数据是DNA测序的结果,为研究者提供了进一步深度挖掘生物信息的资源,研究者可以在以下几方面展开研究:(1)判断DNA链的某一特定位置会出现何种组蛋白修饰;(2)检测RNA polymerase II及其它反式因子在基因组上结合位点的精确定位;(3)研究组蛋白共价修饰与基因表达的关系;(4)CTCF转录因子研究.
翁饶17291326809：
怎么把染色体转化成基因名字 chip seq -
22814延质
： 46:46条染色体;XY:指男性;del(15q11.1q13.1):指15号染色体q11.1到15号染色体q13.1位置片段缺失;seq[GRCh37/hg19](20,415,466-28,406,915)*1:指以GRCh37/hg19的人类参考序列为蓝本,15号染色体20,415,466-28,406,915位置为1拷贝(也就是缺失的意思),是del(15q11.1q13.1)的另一种表示方法.
翁饶17291326809：
ChIP - seq能研究哪些蛋白,只有转录因子吗? -
22814延质
： 研究直接结合DNA的蛋白或者调控这类蛋白的因子都可以.要弄清楚CHIP本质就是用抗体把它所识别的蛋白质(包括在CHIP过程中仍然能和这个蛋白结合的DNA和蛋白质等)给免疫沉淀下来,再分析这个免疫沉淀物里的DNA序列.所以只要能保证CHIP过程中你关注的蛋白和其他转录因子的结合不会被破坏,就可以来实现你的目的.
翁饶17291326809：
CHIP - qPCR/CHIP - Seq,哪个更好做 -
22814延质
： 随着学科的发展,目前许多研究都涉及高通量数据分析 (high throughput data analysis). 比较常见的是测序结果分析,例如RNA-seq、CHIP等等. 众所周知,数据分析是高通量测序应用于生物研究最关键的步骤,分析不好,得到的海量数据无异于一堆垃.
