连接两个氨基酸分子的化学键叫做
生物里叫肽键，化学里叫酰胺键。两分子氨基酸缩合成为二肽，二肽仍有自由α-氨基和α-羧基,能同样借肽键与其他氨基酸缩合成三肽，相同的反应可继续进行。肽键中的C—N键的键长短于C=N键长，长于一般C—N键的键长；肽键中的C一N键具有部分双键性质，不能自由旋转。
肽键平面中除C一N键不能旋转外，两侧的C一N和C一C。键均为键，因而相邻的肽键平面可围绕C。旋转，肽链的主链骨架也可视为由一系列通过C。
原子衔接的肽键平面所组成，肽键平面的旋转所产生的立体结构可呈现多种状态，从而导致蛋白质分子呈各种不同的构象。肽链中的自由氨基、羧基及残基侧链的其它基团可发生与氨某酸中相应基团相类似的化学反应。
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