组蛋白chip-seq
答：【答案】： 染色质免疫共沉淀技术（ChromatinImmunoprecipitation，ChIP）也称结合位点分析法，是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具，通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区...
答：Chip-seq，即染色质免疫沉淀-测序（Chromatin Immunoprecipitation-sequencing）技术，是一种强大的生物研究手段，用于解析细胞内蛋白质与DNA之间的相互作用。它结合了ChIP技术，专注于转录因子结合位点和特定DNA修饰位点的研究，尤其是在基因组层面。其工作原理是首先通过ChIP技术富集目标蛋白结合的DNA片段，通过纯...
答：1. ChIP-seqChIP-seq是结合染色质免疫沉淀和高通量测序的技术，用于检测特定DNA关联蛋白的位置。它通过抗体筛选目标蛋白与DNA的结合位点，涉及组蛋白修饰和转录因子调控。1.1 组蛋白修饰：组蛋白的N端尾部修饰（如甲基化、磷酸化、乙酰化等）影响染色质构型，从而影响基因表达。例如，H3K4me1与增强子区相...
答：CHIP-seq研究主要涉及对客户提供的ChIP样品进行定量检测，确保样本质量后，进一步进行测序文库构建的过程。首先，DNA被转化为簇状（Cluster generation）并进行扩增，然后通过高通量测序技术获取大量数据。在数据产出阶段，我们执行基础分析，包括对测序结果进行图像识别，以识别碱基序列（Base calling），并剔除污...
答：组蛋白修饰chipseq和转录因子chipseq区别是形状不同。1、组蛋白修饰chipseq是圆形，点状结合和更长的染色质结构域。2、转录因子结合是棱形，它的特征峰，峰型高，而且窄。
答：我们一般用 ChIPseq 检测转录因子的结合，以及检测组蛋白修饰，二者有着截然不同的峰形：转录因子结合的特征峰，峰型高，而且窄：组蛋白修饰结合的特征峰，峰型起伏，而且分布广泛：当然我们也可以使用，UCSC基因组浏览器显示。一般在做ChIPseq时，会加入一组空白对照（control），提高峰质量，那么为什么？
答：ChIP-qPCR是对分离和纯化后的染色质免疫沉淀的DNA进行定量PCR分析，检测特定区域蛋白质结合的丰度。这能揭示转录因子、组蛋白修饰等对基因表达的调节效果。ChIP-Seq技术则是结合第二代测序技术，能高效地在全基因组水平上检测与组蛋白、转录因子等相互作用的DNA片段，提供更全面的基因调控信息。碧云天生产的...
答：因此可通过CHIP-seq分析组蛋白修饰的分布寻找基因的启动子区和增强子区域及其是激活或抑制基因表达。H3K4me1可作为增强子的标志，H3K4me3作为启动子标志。研究表明，H3K4me1和H3K4me3与基因激活相关，H3K4me3主要富集在转录起始位点附近的启动子区域，而大多数H3K4me1修饰富集在增强子区域；H3K27ac与基因激活相关...
答：其中,scChIP-seq可从低输入样本中以单细胞分辨率对组蛋白修饰和其他染色质结合蛋白进行全基因组分析。最近,用于单细胞标记和ChIP-seq库制备的多种方法用于单细胞标记和ChIP-seq文库制备;这些方法使用微流体系统,Tn5转座酶标记,和ChIP-free的策略。 第一个scChIP-seq方法scDrop-ChIP [17]使用微流体系统进行细胞标记...
答：ChIL-seq 避免了传统ChIP-seq技术中由于抗体沉淀所带来的回收率低的缺陷，尤其适用于贴壁细胞。对于活跃的组蛋白标记如H3K4me3 ，H3K27ac，起始细胞用量甚至可降低至单细胞水平。[2]原理：在96孔板中加入细胞，经固定，染色后加入一抗与目标蛋白结合，随后加入ChIL探针（由二抗和ChIL DNA组成），探针中的...
网友评论：
苍房17027666124：
CHIP - seq的基本介绍 -
515益顾
： 染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究.将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段.ChIP-Seq的原理是:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序.研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息.
苍房17027666124：
ChIP - seq能研究哪些蛋白,只有转录因子吗? -
515益顾
： 研究直接结合DNA的蛋白或者调控这类蛋白的因子都可以.要弄清楚CHIP本质就是用抗体把它所识别的蛋白质(包括在CHIP过程中仍然能和这个蛋白结合的DNA和蛋白质等)给免疫沉淀下来,再分析这个免疫沉淀物里的DNA序列.所以只要能保证CHIP过程中你关注的蛋白和其他转录因子的结合不会被破坏,就可以来实现你的目的.
苍房17027666124：
索引是不是分为唯一索引和非唯一索引 -
515益顾
： 在某些情况下,比如,对组蛋白修饰的ChIP-seq数据peak-calling时,“双峰模型”会建立失败,这是因为组蛋白修饰往往并不是孤立 存在的,可能很长一段染色质区间都被同一个组蛋白修饰占据,换句话说,组蛋白修饰的peak并不典型.
苍房17027666124：
一个有关chip - seq的问题我想做测的2个chip - seq重复间的peak的相关性,用的是intersectBed - a a.bed - b b.bed - f 0.05 这样来找overlap的peak的个数,然后用... -
515益顾
：[答案] 染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究.将ChIP与第二代测序技术相结合的...
苍房17027666124：
基因组学的研究热点是什么 -
515益顾
： 这个问得太宽泛了,回答压力大啊.首先要看是根据研究对象分类,还是关注的层面分类 - 根据研究对象可以大致分为动植物,人类健康和微生物 1. 动植物方向近年热点包括基因组辅助分子育种,和杂合物种(如水产、林木等)基因组图谱绘制...
苍房17027666124：
如何利用MACS注释和可视化ChIP - seq结果 -
515益顾
： 这里的提示已经提供操作步骤了 第一:选择顶部菜单【查看】 第二:选择【可视化助理】 第三:把不可见的元素前全打上勾即可.
苍房17027666124：
chip - seq找转录因子结合位点用什么抗体 -
515益顾
： 在clade选择Mammal,genome选择Human,assmebly选择最新的数据库,gene中输入ANKH,在track中选择RefSeq Genes,在output format中选择sequence,点击get output,根据需要选择序列,选择genomic-submit.
